老師您好幔荒,請問GEO的芯片可以取log后做WGCNA和免疫浸潤嗎羡宙?
芯片數(shù)據和RNA-seq的差異分析流程由于太久沒有分析過bulk數(shù)據了堵漱,前幾天突然被要求分析一個文章的數(shù)據時有點亂了手腳,所以在這里想總結一下關于芯片數(shù)據與seq數(shù)據的差異分析流程篮条。 假如你是小白瘟芝,也剛剛了解NG...
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由于太久沒有分析過bulk數(shù)據了捆姜,前幾天突然被要求分析一個文章的數(shù)據時有點亂了手腳,所以在這里想總結一下關于芯片數(shù)據與seq數(shù)據的差異分析流程迎膜。 假如你是小白泥技,也剛剛了解NG...
你好,請問這個問題解決了嗎磕仅,我也想知道
GEO/TCGA數(shù)據是否需要標準化的問題一.對于芯片數(shù)據: GEO中的Series Matrix File(s)通常是經過了標準化和對數(shù)轉換的數(shù)據珊豹,但是不是所有的都是 具體判斷方法: 表達量是否需要重新標準化: 可...