大家好，上一期介紹了GWAS的基本原理，中間提到了基因型數(shù)據(jù)暮刃⊙〖梗基因型數(shù)據(jù)的獲取方式有很多衩椒，例如基因芯片凹耙、簡化基因組測序嗦篱、全基因組重測序等填物。在人類中通過基因芯片獲取的測序數(shù)據(jù)往...
發(fā)簡信
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GWAS基因型文件介紹——VCF文件
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LDdecay（連鎖不平衡檢測）
1 安裝PopLDdecay莱褒，優(yōu)點：方便不需要轉(zhuǎn)換格式（plink需要） ## 下載 git clone https://github.com/BGI-shenzhen/Po...
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Haploview軟件使用-連鎖不平衡分析
當位于某一座位的特定等位基因與另一座位的某一等位基因同時出現(xiàn)的概率大于群體中因隨機分布的兩個等位基因同時出現(xiàn)的概率時，就稱這兩個座位處于連鎖不平衡的狀態(tài)涎劈。目前广凸，連鎖不平衡分析...
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2020-01-10 分析SNP位點：連鎖不平衡-可視化R包LDheatmap參考學習資料：https://cran.r-project.org/web/packages/LDheatmap/LDheatmap.pdf 二代測序得到的那些SNP蹦浦，有些是...
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GWAS筆記2-連鎖不平衡LD連鎖不平衡（linkage disequilibrium）是進化生物學與人類遺傳學中一個十分重要的概念扭吁，因為遺傳過程中很多因素能夠影響它，而它又會作用于很多因素盲镶，包括選擇侥袜，重...
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連鎖不平衡以及連鎖不平衡衰減[連鎖不平衡粗俗的說就是：這幾個基因耍流氓，喜歡抱團遺傳溉贿，不再隨機枫吧。而連鎖不平衡衰減是指在基因組上，隨著物理距離的增大顽照，兩個連鎖的的等位基因的連鎖程度不斷減小。] LD衰減圖...
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基礎(chǔ)知識——連鎖不平衡 Linkage disequilibrium (LD)一、概念 連鎖不平衡是指,在某一群體中爷狈，分屬兩個或兩個以上基因座的等位基因同時出現(xiàn)在一條染色體上的幾率植影，高于隨機出現(xiàn)的頻率。連鎖不平衡是等位基因或者遺傳標記在一個種群中表現(xiàn)出...
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【糖尿病.2003】糖尿病涎永、氧化應(yīng)激和抗氧化劑：綜述文獻DOI： 10.1002/jbt.10058 文獻PMID： 12616644 文獻原文鏈接： http://doi.org.sci-hub.tw/10.1002/jbt...
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【創(chuàng)面修復.2011】糖尿病慢性傷口非愈合患者氧化應(yīng)激與細胞凋亡標志物的關(guān)系&Relationship between oxidative stress and apoptotic markers in lymphocytes of diabetic...
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功能解剖學1-8.Codman矛盾理論《功能解剖學》讀書筆記之【8.Codman矛盾理論】 Codman操作法執(zhí)行如下※在參考位置（圖1-26側(cè)面觀，圖1-27后面觀）妈倔，上肢下垂于軀干兩側(cè)博投，拇指向前，手掌朝向內(nèi)側(cè)...
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從一篇11分SCI看孟德爾隨機化怎么發(fā)高分大家好盯蝴，好久不見毅哗，現(xiàn)在純做轉(zhuǎn)錄組想發(fā)個文章已經(jīng)越來越卷了听怕，而且好多期刊已經(jīng)明確規(guī)定了要加實驗，對臨床gou特別不友好虑绵。那么有沒有不用做實驗還可以發(fā)高分的文章呢尿瞭？答案很明確，是...
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R數(shù)據(jù)分析：孟德爾隨機化實操
好多同學詢問孟德爾隨機化的問題翅睛，我再來嘗試著梳理一遍声搁，希望對大家有所幫助，首先看下圖1分鐘宏所，盯著看將下圖印在腦海中： [圖片上傳失敗...(image-9bf17c-1668...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)繪制PCA圖以及生物學重復的相關(guān)問題
很久沒有跟新啦~~~忙著基金爬骤。充石。基金霞玄。骤铃。還是基金，然后就是文章坷剧。惰爬。文章。惫企。還是文章撕瞧。終于有空整理之前的東西。 說繪圖方法之前先要了解狞尔，轉(zhuǎn)錄組的PCA圖的意義是什么丛版？為了檢測樣...
