大家好盾碗，上一期介紹了GWAS的基本原理，中間提到了基因型數(shù)據(jù)舀瓢≈枚基因型數(shù)據(jù)的獲取方式有很多，例如基因芯片氢伟、簡(jiǎn)化基因組測(cè)序榜轿、全基因組重測(cè)序等。在人類中通過(guò)基因芯片獲取的測(cè)序數(shù)據(jù)往...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：香港
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GWAS基因型文件介紹——VCF文件
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GWAS簡(jiǎn)介
GWAS我做了很長(zhǎng)時(shí)間朵锣，對(duì)這門技術(shù)我有很深的感情谬盐，而且在post-GWAS的時(shí)代到來(lái)之后，我也越發(fā)感覺這項(xiàng)技術(shù)其實(shí)有著廣闊的應(yīng)用空間诚些，因此我想將這項(xiàng)技術(shù)及我在應(yīng)用時(shí)所出現(xiàn)的b...
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LDdecay（連鎖不平衡檢測(cè)）
1 安裝PopLDdecay飞傀，優(yōu)點(diǎn)：方便不需要轉(zhuǎn)換格式（plink需要） ## 下載 git clone https://github.com/BGI-shenzhen/Po...
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Haploview軟件使用-連鎖不平衡分析
當(dāng)位于某一座位的特定等位基因與另一座位的某一等位基因同時(shí)出現(xiàn)的概率大于群體中因隨機(jī)分布的兩個(gè)等位基因同時(shí)出現(xiàn)的概率時(shí)皇型，就稱這兩個(gè)座位處于連鎖不平衡的狀態(tài)。目前砸烦，連鎖不平衡分析...
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2020-01-10 分析SNP位點(diǎn)：連鎖不平衡-可視化R包LDheatmap參考學(xué)習(xí)資料：https://cran.r-project.org/web/packages/LDheatmap/LDheatmap.pdf 二代測(cè)序得到的那些SNP，有些是...
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GWAS筆記2-連鎖不平衡LD連鎖不平衡（linkage disequilibrium）是進(jìn)化生物學(xué)與人類遺傳學(xué)中一個(gè)十分重要的概念颜说，因?yàn)檫z傳過(guò)程中很多因素能夠影響它购岗，而它又會(huì)作用于很多因素，包括選擇门粪，重...
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連鎖不平衡以及連鎖不平衡衰減[連鎖不平衡粗俗的說(shuō)就是：這幾個(gè)基因耍流氓喊积，喜歡抱團(tuán)遺傳，不再隨機(jī)玄妈。而連鎖不平衡衰減是指在基因組上乾吻，隨著物理距離的增大，兩個(gè)連鎖的的等位基因的連鎖程度不斷減小拟蜻。] LD衰減圖...
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基礎(chǔ)知識(shí)——連鎖不平衡 Linkage disequilibrium (LD)一瞭郑、概念 連鎖不平衡是指,在某一群體中辜御，分屬兩個(gè)或兩個(gè)以上基因座的等位基因同時(shí)出現(xiàn)在一條染色體上的幾率，高于隨機(jī)出現(xiàn)的頻率屈张。連鎖不平衡是等位基因或者遺傳標(biāo)記在一個(gè)種群中表現(xiàn)出...
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【糖尿病.2003】糖尿病擒权、氧化應(yīng)激和抗氧化劑：綜述文獻(xiàn)DOI： 10.1002/jbt.10058 文獻(xiàn)PMID： 12616644 文獻(xiàn)原文鏈接： http://doi.org.sci-hub.tw/10.1002/jbt...
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【創(chuàng)面修復(fù).2011】糖尿病慢性傷口非愈合患者氧化應(yīng)激與細(xì)胞凋亡標(biāo)志物的關(guān)系&Relationship between oxidative stress and apoptotic markers in lymphocytes of diabetic...
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功能解剖學(xué)1-8.Codman矛盾理論《功能解剖學(xué)》讀書筆記之【8.Codman矛盾理論】 Codman操作法執(zhí)行如下※在參考位置（圖1-26側(cè)面觀场绿，圖1-27后面觀）剖效，上肢下垂于軀干兩側(cè)，拇指向前焰盗，手掌朝向內(nèi)側(cè)...
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從一篇11分SCI看孟德爾隨機(jī)化怎么發(fā)高分大家好璧尸，好久不見，現(xiàn)在純做轉(zhuǎn)錄組想發(fā)個(gè)文章已經(jīng)越來(lái)越卷了熬拒，而且好多期刊已經(jīng)明確規(guī)定了要加實(shí)驗(yàn)爷光，對(duì)臨床gou特別不友好。那么有沒有不用做實(shí)驗(yàn)還可以發(fā)高分的文章呢澎粟？答案很明確蛀序，是...
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R數(shù)據(jù)分析：孟德爾隨機(jī)化實(shí)操
好多同學(xué)詢問(wèn)孟德爾隨機(jī)化的問(wèn)題欢瞪，我再來(lái)嘗試著梳理一遍，希望對(duì)大家有所幫助徐裸，首先看下圖1分鐘遣鼓，盯著看將下圖印在腦海中： [圖片上傳失敗...(image-9bf17c-1668...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)繪制PCA圖以及生物學(xué)重復(fù)的相關(guān)問(wèn)題
很久沒有跟新啦~~~忙著基金骑祟。∶世眩基金曾我。粉怕。還是基金健民，然后就是文章。贫贝。文章秉犹。。還是文章稚晚。終于有空整理之前的東西崇堵。 說(shuō)繪圖方法之前先要了解，轉(zhuǎn)錄組的PCA圖的意義是什么客燕？為了檢測(cè)樣...
