大家好武学，上一期介紹了GWAS的基本原理封恰，中間提到了基因型數(shù)據(jù)÷鸢希基因型數(shù)據(jù)的獲取方式有很多匠抗，例如基因芯片灭翔、簡化基因組測序头滔、全基因組重測序等。在人類中通過基因芯片獲取的測序數(shù)據(jù)往...
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GWAS基因型文件介紹——VCF文件
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LDdecay（連鎖不平衡檢測）
1 安裝PopLDdecay刽沾，優(yōu)點(diǎn)：方便不需要轉(zhuǎn)換格式（plink需要） ## 下載 git clone https://github.com/BGI-shenzhen/Po...
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Haploview軟件使用-連鎖不平衡分析
當(dāng)位于某一座位的特定等位基因與另一座位的某一等位基因同時(shí)出現(xiàn)的概率大于群體中因隨機(jī)分布的兩個(gè)等位基因同時(shí)出現(xiàn)的概率時(shí)，就稱這兩個(gè)座位處于連鎖不平衡的狀態(tài)排拷。目前侧漓，連鎖不平衡分析...
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2020-01-10 分析SNP位點(diǎn)：連鎖不平衡-可視化R包LDheatmap參考學(xué)習(xí)資料：https://cran.r-project.org/web/packages/LDheatmap/LDheatmap.pdf 二代測序得到的那些SNP浪腐，有些是...
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GWAS筆記2-連鎖不平衡LD連鎖不平衡（linkage disequilibrium）是進(jìn)化生物學(xué)與人類遺傳學(xué)中一個(gè)十分重要的概念纵揍，因?yàn)檫z傳過程中很多因素能夠影響它，而它又會作用于很多因素议街，包括選擇泽谨，重...
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連鎖不平衡以及連鎖不平衡衰減[連鎖不平衡粗俗的說就是：這幾個(gè)基因耍流氓，喜歡抱團(tuán)遺傳，不再隨機(jī)吧雹。而連鎖不平衡衰減是指在基因組上骨杂，隨著物理距離的增大，兩個(gè)連鎖的的等位基因的連鎖程度不斷減小雄卷。] LD衰減圖...
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基礎(chǔ)知識——連鎖不平衡 Linkage disequilibrium (LD)一丁鹉、概念 連鎖不平衡是指,在某一群體中妒潭，分屬兩個(gè)或兩個(gè)以上基因座的等位基因同時(shí)出現(xiàn)在一條染色體上的幾率，高于隨機(jī)出現(xiàn)的頻率鳄炉。連鎖不平衡是等位基因或者遺傳標(biāo)記在一個(gè)種群中表現(xiàn)出...
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【糖尿病.2003】糖尿病杜耙、氧化應(yīng)激和抗氧化劑：綜述文獻(xiàn)DOI： 10.1002/jbt.10058 文獻(xiàn)PMID： 12616644 文獻(xiàn)原文鏈接： http://doi.org.sci-hub.tw/10.1002/jbt...
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【創(chuàng)面修復(fù).2011】糖尿病慢性傷口非愈合患者氧化應(yīng)激與細(xì)胞凋亡標(biāo)志物的關(guān)系&Relationship between oxidative stress and apoptotic markers in lymphocytes of diabetic...
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功能解剖學(xué)1-8.Codman矛盾理論《功能解剖學(xué)》讀書筆記之【8.Codman矛盾理論】 Codman操作法執(zhí)行如下※在參考位置（圖1-26側(cè)面觀谈竿，圖1-27后面觀），上肢下垂于軀干兩側(cè)摸吠，拇指向前空凸，手掌朝向內(nèi)側(cè)...
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從一篇11分SCI看孟德爾隨機(jī)化怎么發(fā)高分大家好，好久不見寸痢，現(xiàn)在純做轉(zhuǎn)錄組想發(fā)個(gè)文章已經(jīng)越來越卷了呀洲，而且好多期刊已經(jīng)明確規(guī)定了要加實(shí)驗(yàn)，對臨床gou特別不友好啼止。那么有沒有不用做實(shí)驗(yàn)還可以發(fā)高分的文章呢道逗？答案很明確，是...
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R數(shù)據(jù)分析：孟德爾隨機(jī)化實(shí)操
好多同學(xué)詢問孟德爾隨機(jī)化的問題献烦，我再來嘗試著梳理一遍滓窍，希望對大家有所幫助，首先看下圖1分鐘巩那，盯著看將下圖印在腦海中： [圖片上傳失敗...(image-9bf17c-1668...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)繪制PCA圖以及生物學(xué)重復(fù)的相關(guān)問題
很久沒有跟新啦~~~忙著基金即横。噪生。基金东囚。跺嗽。還是基金，然后就是文章。抛蚁。文章陈醒。。還是文章瞧甩。終于有空整理之前的東西钉跷。 說繪圖方法之前先要了解，轉(zhuǎn)錄組的PCA圖的意義是什么肚逸？為了檢測樣...
