寫(xiě)在前面 簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō)唆垃,hub基因就是網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)連接的瓶頸基因,一個(gè)連接了很多節(jié)點(diǎn)的基因痘儡。這篇文章仍然來(lái)自幾篇文章及自己平時(shí)的積累辕万,主要闡述關(guān)鍵基因和hub基因。很多人誤以為hu...
hello大家好宝惰,小月亮又和大家見(jiàn)面了植榕。上篇軟文小月亮給大家介紹了NetworkAnalyst3.0工具的概覽。這次小月亮就給大家詳細(xì)介紹NetworkAnalyst3.0工...
01 MEGENA概要 基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析可以有效鑒定與復(fù)雜人類(lèi)疾病相關(guān)的功能性共表達(dá)基因模塊谷誓。最常用的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析是加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA),它將復(fù)雜生物過(guò)程...
寫(xiě)在前面 這篇文章仍然來(lái)自幾篇文章及自己平時(shí)的積累,主要闡述關(guān)鍵基因和hub基因鸵钝。很多人誤以為hub基因就是關(guān)鍵基因糙臼,甚至有人認(rèn)為差異表達(dá)基因就是關(guān)鍵基因。在正式看本文章之前...
操作系統(tǒng):win10R版本:R-3.3.3 前期準(zhǔn)備 安裝pandoc 下載鏈接:https://pan.baidu.com/s/1nvMA1Rz (感謝 @喬布斯的同學(xué)) ...
常用的工具某個(gè)基因的研究現(xiàn)狀--pubmed文獻(xiàn)自動(dòng)分析工具EVEX數(shù)據(jù)庫(kù)cytoscape的插件參考鏈接stringstring教程 Cytoscape的使用 Cytosc...
前言 今天來(lái)討論下利用Tree-Based的方法來(lái)建立基因之間的調(diào)控關(guān)系,最近看到一篇17年發(fā)表在Nature Methods的文章《SCENIC: single-cell ...
Xavier A, Muir WM, Craig B, Rainey KM (2016) Walking through the statistical black boxe...
Yousry A. El-Kassaby, Fikret Isik, and Ross W. Whetten. Modern Advances in Tree Breedin...
WGCNA分析基于兩個(gè)假設(shè):1.相似表達(dá)模式的基因可能存在共調(diào)控凰棉、功能相關(guān)或處于同一通路,2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無(wú)尺度分布陌粹∪鱿基于這兩點(diǎn),可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達(dá)相似性劃分為不同的模塊...