寫在前面 簡單來說畅姊,hub基因就是網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點連接的瓶頸基因,一個連接了很多節(jié)點的基因吹由。這篇文章仍然來自幾篇文章及自己平時的積累若未,主要闡述關(guān)鍵基因和hub基因。很多人誤以為hu...
hello大家好,小月亮又和大家見面了疯特。上篇軟文小月亮給大家介紹了NetworkAnalyst3.0工具的概覽撵割。這次小月亮就給大家詳細介紹NetworkAnalyst3.0工...
01 MEGENA概要 基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析可以有效鑒定與復雜人類疾病相關(guān)的功能性共表達基因模塊馏锡。最常用的共表達網(wǎng)絡(luò)分析是加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)雷蹂,它將復雜生物過程...
寫在前面 這篇文章仍然來自幾篇文章及自己平時的積累,主要闡述關(guān)鍵基因和hub基因责蝠。很多人誤以為hub基因就是關(guān)鍵基因党巾,甚至有人認為差異表達基因就是關(guān)鍵基因。在正式看本文章之前...
操作系統(tǒng):win10R版本:R-3.3.3 前期準備 安裝pandoc 下載鏈接:https://pan.baidu.com/s/1nvMA1Rz (感謝 @喬布斯的同學) ...
常用的工具某個基因的研究現(xiàn)狀--pubmed文獻自動分析工具EVEX數(shù)據(jù)庫cytoscape的插件參考鏈接stringstring教程 Cytoscape的使用 Cytosc...
前言 今天來討論下利用Tree-Based的方法來建立基因之間的調(diào)控關(guān)系,最近看到一篇17年發(fā)表在Nature Methods的文章《SCENIC: single-cell ...
Xavier A, Muir WM, Craig B, Rainey KM (2016) Walking through the statistical black boxe...
Yousry A. El-Kassaby, Fikret Isik, and Ross W. Whetten. Modern Advances in Tree Breedin...
WGCNA分析基于兩個假設(shè):1.相似表達模式的基因可能存在共調(diào)控砸狞、功能相關(guān)或處于同一通路,2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無尺度分布镀梭〉渡基于這兩點,可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達相似性劃分為不同的模塊...