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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）基于馬爾可夫過程和RNA速率的細(xì)胞命運(yùn)預(yù)測（Cellrank）hello，今天我們來分享一個(gè)更加完善的單細(xì)胞軌跡分析的軟件问窃，cellrank亥鬓，文章在CellRank for directed single-cell fate mappi...
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CytoTRACE 原理及代碼解釋CytoTRACE是一款基于單細(xì)胞計(jì)數(shù)矩陣推測細(xì)胞間活性和細(xì)胞間相對(duì)分化狀態(tài)的一款軟件域庇，這里我們結(jié)合實(shí)際代碼例子嵌戈，解釋CytoTRACE的數(shù)學(xué)原理： step 1:這一步先將...
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搬磚的工人<br>
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SCENIC: 單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和細(xì)胞功能聚類作者：ahworld鏈接：SCENIC | 以single-cell RNA-seq數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和細(xì)胞功能聚類)來源：微信公眾號(hào)著作權(quán)歸作者所有危喉，任何形式的轉(zhuǎn)載都請聯(lián)...
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幫BBC做個(gè)宣傳??做一次標(biāo)題黨摘完，其實(shí)只是學(xué)習(xí)BBC數(shù)據(jù)分析團(tuán)隊(duì)的可視化方案的一點(diǎn)學(xué)習(xí)筆記姥饰。經(jīng)過一點(diǎn)點(diǎn)翻譯，也經(jīng)過自己的篩選的如果學(xué)原文點(diǎn)這里孝治。首先看圖的效果列粪。很典型的ggplot2風(fēng)格的圖...
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CellChat：細(xì)胞間相互作用分析利器前言 我們知道，細(xì)胞間信息傳遞方式一個(gè)是細(xì)胞表面配受體的相互作用手素，另一個(gè)通過細(xì)胞產(chǎn)生的可溶性小分子鸳址，即細(xì)胞因子。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中下游泉懦，有時(shí)候我們想看某幾種細(xì)胞類型之間的相互...
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單細(xì)胞綜述之整合分析文章發(fā)表于nature review genetics：Integrative single- cell analysis稿黍，作者是Tim Stuart與Rahul Satij...
