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10X單細胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）基于馬爾可夫過程和RNA速率的細胞命運預測（Cellrank）hello劳跃，今天我們來分享一個更加完善的單細胞軌跡分析的軟件蛀蜜，cellrank称杨，文章在CellRank for directed single-cell fate mappi...
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CytoTRACE 原理及代碼解釋CytoTRACE是一款基于單細胞計數(shù)矩陣推測細胞間活性和細胞間相對分化狀態(tài)的一款軟件止潘，這里我們結(jié)合實際代碼例子俐镐，解釋CytoTRACE的數(shù)學原理： step 1:這一步先將...
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SCENIC: 單細胞RNA-seq數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡和細胞功能聚類作者：ahworld鏈接：SCENIC | 以single-cell RNA-seq數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡和細胞功能聚類)來源：微信公眾號著作權歸作者所有萌庆，任何形式的轉(zhuǎn)載都請聯(lián)...
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CellChat：細胞間相互作用分析利器前言 我們知道俯抖，細胞間信息傳遞方式一個是細胞表面配受體的相互作用，另一個通過細胞產(chǎn)生的可溶性小分子瓦胎，即細胞因子芬萍。在單細胞數(shù)據(jù)分析中下游，有時候我們想看某幾種細胞類型之間的相互...
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單細胞綜述之整合分析文章發(fā)表于nature review genetics：Integrative single- cell analysis搔啊，作者是Tim Stuart與Rahul Satij...
