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可以分享一下可視化的方法嗎
基因家族分析 | 預(yù)測基因家族收縮與擴(kuò)張（orthofinder，cafe）
以下參照 hoptop的「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進(jìn)行直系同源基因分析這篇帖子試跑了一遍 1.軟件安裝 2.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 下載「基因組學(xué)」使用OrthoFinder進(jìn)...
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老師您好逃默，我想問一下我運(yùn)行完orthofinder鹃愤，genetree文件夾下面啥也沒有是什么情況呢
基因家族分析之orthofinder后續(xù)結(jié)果的R分析基因樹
利用orthofinder分析基因家族后，可以獲得genetree和speciestree 結(jié)果完域。我們可以利用R包來可視化基因樹和物種數(shù)软吐，并對其進(jìn)行簡單的編輯。 1.下載安裝...
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OrthoFinder尋找同源基因并建樹（1）一吟税、OrthoFinder的安裝 使用之前記得查看幫助文檔: 二凹耙、OrthoFinder的使用OrthoFinder需要蛋白編碼的Fasta（fa）文件作為輸入，所以首先我們...
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怎么解決的啊
為什么orthofinder的結(jié)果沒有g(shù)ene_tree的文件肠仪？
我重新運(yùn)行了三次肖抱，但總是沒有g(shù)ene_tree的文件，我真是要哭了异旧，怎么就是沒有結(jié)果呢意述？難道是數(shù)據(jù)文件沒有處理好？但是我是從ncbi下載的fasta蛋白序列吮蛹，我也檢查了荤崇，沒有...
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Orthofinder 2.3Homolog是同源基因。 Orthologs,Orthologues 直系同源潮针，是指不同物種之間的基因术荤，起源于共同的祖先，基因功能可能一樣每篷，但又因?yàn)檫M(jìn)化的關(guān)系瓣戚，使得功能有...
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零基礎(chǔ)多物種間共線性分析首先非常感謝Cj大神開發(fā)出來的TBtools生信工具，為生信分析做圖帶來了極大的便利焦读。作為生信小白子库，在做多物種間共線性分析時(shí)，嘗試了多種方法矗晃，苦于沒有計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)仑嗅，一直沒能完成...
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SCAU課堂 | 「比較基因組分析」專用 Docker 鏡像寫在前面 沒想到，上個(gè)選修課，準(zhǔn)備示例數(shù)據(jù)和鏡像上无畔，竟然花了我三四天....主要原因還是，「網(wǎng)速太差」吠冤。搞七搞八浑彰，終于搞定。盡管整完之后拯辙，我其實(shí)擔(dān)心學(xué)生拿到這個(gè)使用文檔也不知...
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@蒼櫻拍子_3bfe 沒有呀
7. Blast2Go
2019.12.4 https://www.blast2go.com 不知道為啥我的注冊碼激活不了郭变，試了很久，都不行涯保，哎诉濒。出現(xiàn)Please use the OmicsBox ...
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Pannzer2 | 推薦一款強(qiáng)大的Gene Ontology注釋網(wǎng)站很多時(shí)候冶共，我們一直想做到出色，做到出彩每界，但是比我們優(yōu)秀的人捅僵，卻在相同的方向上，做了十年盆犁，出彩了十年命咐，而且他們沒有停下腳步~~ 寫在前面 Emmm，GO注釋常常是一個(gè)有點(diǎn)爭議的...
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零基礎(chǔ)快速完成基因功能注釋 / GO / KEGG / PFAM...寫在前面 早前已經(jīng)推過《新手eggNOG-Mapper詳細(xì)教程》谐岁，但仍然有很多人遇到使用問題醋奠。換句話，可能那個(gè)教程不能徹底解決大伙遇到的問題伊佃。于是我決定寫一個(gè)完美的教程窜司，徹底...
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7. Blast2Go2019.12.4 https://www.blast2go.com 不知道為啥我的注冊碼激活不了塞祈，試了很久，都不行帅涂，哎议薪。出現(xiàn)Please use the OmicsBox ...
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注冊的時(shí)候提示Captcha Empty. Please retry.也沒有看到哪里也填寫尤蛮，請問有解決的辦法嗎
7. Blast2Go
2019.12.4 https://www.blast2go.com 不知道為啥我的注冊碼激活不了，試了很久斯议，都不行产捞，哎。出現(xiàn)Please use the OmicsBox ...
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Orthofinder運(yùn)行結(jié)果文件解讀OrthoFinder結(jié)果文件 運(yùn)行標(biāo)準(zhǔn)OrthoFinder會產(chǎn)生一系列文件：直系同源組、直系同源恋昼、基因樹看靠、物種樹、基因復(fù)制事件液肌、比較基因組學(xué)數(shù)據(jù)挟炬。結(jié)果文件在所分析物種的....
