周運(yùn)來，男票编，長大了才會遇到的帥哥，穩(wěn)健须揣，瀟灑葛虐，大方，靠譜译株。一段生信緣瓜喇，一棵技能樹。生信技能樹核心成員歉糜，單細(xì)胞天地供稿人乘寒，簡書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家匪补。
發(fā)簡信
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生物信息學(xué)研究毁葱。
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從不回頭看爆炸
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關(guān)注：六博說 第一時(shí)間獲取更新
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【生信工具】快速繪制發(fā)表級圖片ggplot2智能版ggpubr包學(xué)習(xí)總結(jié)軟件簡介 Hadley Wickham編寫的ggplot2[https://ggplot2.tidyverse.org/]是出色且靈活的作圖軟件包，可用于R中的優(yōu)雅數(shù)據(jù)可視化...
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本專題為簡書各位生信作者記錄或者編寫的基因家族分析的教程。
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在線工具網(wǎng)站，生物分析的一些網(wǎng)站或者數(shù)據(jù)庫之類的文章梨水。??相關(guān)的文章會在收錄時(shí)間上相近拭荤，請點(diǎn)擊『最新收錄』 ?????????????????????????? ?? 數(shù)據(jù)庫，比如Ensembl疫诽、Phytome ?? 癌癥分析網(wǎng)站舅世，比如GEPIA笼恰、cBioportal ?? 系統(tǒng)發(fā)育樹的美化，比如iTOL ?? 基因注釋歇终，比如Metascape、KASS ?? 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測逼龟，比如pfam评凝、SMART ?? 在線繪制統(tǒng)計(jì)圖，比如Venny ?? 序列比對腺律，比如blast ?? 引物設(shè)計(jì)奕短，比如primer3、primer-blast ?? 文獻(xiàn)下載匀钧，比如sci-hub翎碑，文獻(xiàn)鳥 ?? 。之斯。日杈。
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個(gè)人學(xué)習(xí)生信的一點(diǎn)心得 歡迎討論指摘
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農(nóng)學(xué)跨生信瘫絮，之前總覺得涨冀，沒人教，怕走彎路麦萤，遲遲不肯踏踏實(shí)實(shí)從基礎(chǔ)一點(diǎn)一點(diǎn)積累慢慢學(xué)起鹿鳖。一會看看生物，一會寫寫代碼壮莹，抓不住重點(diǎn)也沒有提高翅帜。 后來關(guān)注了生信技能樹，還蹭了建設(shè)人Jimmy大佬組織的線下聚會垛孔，聽到幾位大佬介紹后藕甩，發(fā)現(xiàn)他們都是自學(xué)，自己摸索的周荐，并且給我強(qiáng)調(diào)了記筆記的重要性狭莱。 這是一個(gè)對知識管理的過程，記錄下學(xué)習(xí)的一點(diǎn)一滴概作，寫下來的筆記是給自己的（有時(shí)候會覺得寫的不好腋妙，也不敢分享出來，沒有正向激勵(lì)讯榕，漸漸就不寫了）骤素，當(dāng)然如果也可以像大佬們那樣對他人的學(xué)習(xí)起到幫助匙睹，我也會覺得非常榮幸和開心吶。 加油啦～～
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生信精讀文獻(xiàn)
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生信在線數(shù)據(jù)庫
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一些生物信息學(xué)用到的軟件，工具耸棒，介紹用法安裝以及以及應(yīng)用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades荒澡、canu等等 ?? 序列比對比如blast、bowtie与殃、diamond等 ?? 多序列比對比如mega单山、clustalW、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools奈籽、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS饥侵、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻(xiàn)下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進(jìn)化樹構(gòu)建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL衣屏、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結(jié)構(gòu)變異或者SNP序列GATK躏升、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o、QIMME ?? 測序質(zhì)量評估的FastQC狼忱、BUSCO膨疏、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit钻弄、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
