今天接到一個(gè)小姑娘的咨詢池凄,她問(wèn)我的公眾號(hào)有沒(méi)有兼職可以提供,她可以做一些簡(jiǎn)單的下游分析賺點(diǎn)外快野宜。 我說(shuō)沒(méi)有呀乔妈。 科研服務(wù)是個(gè)苦差事 其實(shí)倒是經(jīng)常有一些讀者來(lái)求助,想要找我們做...
目前主流的免疫浸潤(rùn)計(jì)算方法是CIBERSORT和ssgsea捆等,今天介紹CIBERSORT滞造。 1.輸入數(shù)據(jù)要什么 下面這段話摘自CIBERSORT的介紹 Importantly...
這是ggplot2可視化專題的第三個(gè)實(shí)例操作 【ggplot2的基本思路見(jiàn)前文總論】:基于ggplot2的RNA-seq轉(zhuǎn)錄組可視化:總述和分文目錄 【ggplot2繪圖具體...
坐標(biāo)軸排序 ggplot2 作圖時(shí),x軸有一個(gè)很好用的默認(rèn)排序過(guò)程薯定,但實(shí)際應(yīng)用過(guò)程中往往需要自己決定排序方式蔑祟。 默認(rèn)情況 如果x軸是字符(chr)格式,在使用ggplot2 ...
現(xiàn)在的社會(huì)正處于大數(shù)據(jù)時(shí)代沉唠,生物學(xué)研究領(lǐng)域也迎來(lái)了大組學(xué)時(shí)代。無(wú)論是植物苛败。動(dòng)物满葛,還是微生物,都有許多物種被測(cè)序罢屈。在后續(xù)的個(gè)性化分析過(guò)程中嘀韧,通常會(huì)得到龐大的基因數(shù)據(jù),如何選擇一...
今天我們來(lái)點(diǎn)簡(jiǎn)單的炎辨,實(shí)現(xiàn)通路網(wǎng)絡(luò)圖,如下 這里我們需要調(diào)整很多想要的內(nèi)容聪姿,比如顏色碴萧,線路等等,我們來(lái)學(xué)習(xí)以下 1末购、安裝以及參數(shù)介紹 簡(jiǎn)單介紹主要參數(shù) 2破喻、數(shù)據(jù) 加載基因數(shù)據(jù) ...
簡(jiǎn)介 文章較長(zhǎng),點(diǎn)擊直達(dá)我的博客盟榴,瀏覽效果更好曹质。本文內(nèi)容基本是來(lái)源于STHDA,這是一份十分詳細(xì)的ggplot2使用指南,因此我將其翻譯成中文咆繁,一是有助于我自己學(xué)習(xí)理解讳推,另外...
所涉及的函數(shù) Mutating Joins: inner_join(), left_join(), right_join(), full_join() Filtering J...
https://github.com/sib-swiss[https://github.com/sib-swiss]
最近折騰Shiny的時(shí)候接觸到了一款非常好用的數(shù)據(jù)讀取包。寫一下備忘錄玩般。 1. 自動(dòng)識(shí)別分隔文件 vroom有自動(dòng)識(shí)別文件格式功能银觅,所以不管是csv,還是tsv文件都只需要同...
鏈接 https://github.com/cxli233/FriendsDontLetFriends[https://github.com/cxli233/FriendsD...
哇坏为,rmarkdown原來(lái)還可以這樣究驴。見(jiàn)識(shí)到了??
一個(gè)比較好看的r markdown模板來(lái)自于論文 Removing unwanted variation from large-scaleRNA sequencing data with PRPS 論文里提供了很...
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