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Smartseq2 scRNA小鼠發(fā)育學(xué)習(xí)筆記-4-差異分析及功能注釋 -
珠江醫(yī)院腫瘤科簡書號升薯，同時也歡迎大家關(guān)注我們的微信號狮腿！
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你好，請問這個在mac上的終端可以運行嗎
計算TMB
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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一些生物信息學(xué)用到的軟件策吠，工具，介紹用法安裝以及以及應(yīng)用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades瘩绒、canu等等 ?? 序列比對比如blast猴抹、bowtie、diamond等 ?? 多序列比對比如mega锁荔、clustalW蟀给、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻(xiàn)下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進(jìn)化樹構(gòu)建工具IQtree跋理、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL择克、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結(jié)構(gòu)變異或者SNP序列GATK、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o前普、QIMME ?? 測序質(zhì)量評估的FastQC肚邢、BUSCO、QUAST ?? 可視化工具比如IGV拭卿、3D Genome ?? 測序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit骡湖、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
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利用全基因組和外顯子組測序分析snv,cnv,sv等突變形式
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免疫細(xì)胞組分 免疫基因 PD1 免疫治療biomarker
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公眾號: 醫(yī)科研<br>wechat: YKY7060
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