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  • 學(xué)長(zhǎng),我有個(gè)疑問(wèn)想請(qǐng)教一下宅楞,yahs.out.bin這個(gè)文件生成為空脖卖,于是juicer pre那一步我用aligned.bam替代bin文件,但是最后out_JBAT.txt的文件也是空的蘑拯,這是什么原因呀

    什么年代了钝满,還在用傳統(tǒng)的3D-DNA?

    之前使用的是3D-DNA流程做Hi-C的輔助組裝申窘,它的最大優(yōu)勢(shì)就是輸出結(jié)果可以對(duì)接下游的JBAT(juicerbox with Assembly Tools)進(jìn)行手動(dòng)矯正弯蚜。然...

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    群體遺傳學(xué)與重測(cè)序分析

    分子層面對(duì)生物的研究熟吏,在個(gè)體水平上主要是看單個(gè)基因的變化以及全轉(zhuǎn)錄本的變化(RNA-seq);在對(duì)個(gè)體的研究的基礎(chǔ)上玄窝,開(kāi)始了群體水平的研究牵寺。如果說(shuō)常規(guī)的遺傳學(xué)主要的研究對(duì)象是...

  • 全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組分析

    sample1 sample1基本測(cè)序信息統(tǒng)計(jì) 畫(huà)頻數(shù)分布直方圖 獲取一致性序列CCS 統(tǒng)計(jì)CCS信息 畫(huà)頻數(shù)分布直方圖 CCS分類(lèi) isoseq3 refine(去除plo...

  • 您好建芙,請(qǐng)問(wèn)run_gcdep.R這個(gè)腳本能看一下嗎?

    FG12組裝注釋全過(guò)程

    測(cè)序: RNA-seq:100Xnanopore:80Xresequence:30X 質(zhì)控: 使用fastp對(duì)RNAseq和Resequence測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控Reseque...

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    使用JBrowser配置參考基因組和基因注釋信息

    準(zhǔn)備參考基因組hg19及其基因的注釋文件 使用JBrowser自帶的腳本導(dǎo)入?yún)⒖蓟蚪M序列 導(dǎo)入?yún)⒖蓟蚪M后,會(huì)在當(dāng)前文件夾中生成一個(gè)seq文件夾和trackList.jso...

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