240 發(fā)簡信
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  • 請問2.4中zhujieshu.repeat.gff3是怎么來的呀塞茅?

    基因組circos圖繪制流程記錄

    一、Circos安裝 conda 安裝 conda create --name circos conda install circos 二、circos輸入文件準(zhǔn)備 前提必須...

  • 作者礁芦,這個(gè)可以加個(gè)參數(shù)設(shè)定產(chǎn)物的大小嗎堂氯?

    qPCR | 熒光定量?批量設(shè)計(jì)引物左电,一鍵搞定廉侧!

    寫在前面 Emmm,轉(zhuǎn)錄組篩了十來個(gè)基因券腔,想著擴(kuò)大材料看看表達(dá)模式是否與數(shù)據(jù)體現(xiàn)相符伏穆,于是需要設(shè)計(jì)一下qPCR引物。當(dāng)然纷纫,自然是有一些軟件可以使用枕扫,但用起來不太方便。至少問了...

  • 老師好辱魁,找到多胞后烟瞧,怎么去掉呢诗鸭?

    DoubletFinder

    相信各位做單細(xì)胞的童鞋們,都遇到過去除多細(xì)胞的情況参滴,而Cellranger默認(rèn)的是前1%(3000cell)强岸,對于低質(zhì)量的細(xì)胞有了算法來確認(rèn)是否保留,但是對于多細(xì)胞而言砾赔,Ce...

  • 請問一下蝌箍,輸出結(jié)果中有些null的,例如 Loupe Cell Browser file暴心,這是為什么啊妓盲,對后續(xù)分析會有影響嗎?

    cellranger更新到6.0啦(全新使用教程)

    cellranger是10X GENOMICS單細(xì)胞上游分析的軟件专普,主要有4個(gè)流程 mkfastq悯衬、定量 count、組合 aggr檀夹、reanalyze筋粗。如果是bcl原始測序...

  • 120
    學(xué)習(xí)一遍ChIPseeker的使用

    劉小澤寫于2020.5.23-24Y叔的原文在:https://mp.weixin.qq.com/s/3CMj0xejiV-FSMC-Vxd_-w 0 ChIPseeker的...

  • 您好,請問一下植物的gff3文件不標(biāo)準(zhǔn)炸渡,做出來的txdb不能用怎么解決呀娜亿?謝謝!

    學(xué)習(xí)一遍ChIPseeker的使用

    劉小澤寫于2020.5.23-24Y叔的原文在:https://mp.weixin.qq.com/s/3CMj0xejiV-FSMC-Vxd_-w 0 ChIPseeker的...

  • 請問博主文中用的數(shù)據(jù)是在哪下載的呀偶摔?

    deepTools 的使用(一)

    官方參考 https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/installation.html 下載安裝 python ...

  • 120
    deepTools 的使用(一)

    官方參考 https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/installation.html 下載安裝 python ...

  • 植物構(gòu)建txdb對象

    使用genomicfeatures來構(gòu)建txdb對象暇唾,首先就是安裝對應(yīng)的包 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TR...

  • 樓主好,我根據(jù)您的方法把第一列都改成了“chr+數(shù)字”辰斋,但是后面依然報(bào)錯(cuò)策州,請問您知道怎么回事嗎?

    R: Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for functi...

    第1次用ChIPseeker就遇到了這樣的問題: 然后上網(wǎng)也沒找到對應(yīng)的解決方法宫仗,無奈只好看manual,試了example也沒問題够挂,然后看到peak構(gòu)造的時(shí)候,seqnam...

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