學(xué)習(xí)筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學(xué)<br>
IP屬地：內(nèi)蒙古
-
-
基于Vcf文件進(jìn)行基因單倍型分析單倍型采缚，是單倍體[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的簡稱立轧，在遺傳學(xué)上是指...
-
研究生一枚闸英，主要研究方向?yàn)橹参飪?nèi)生菌及微生物相關(guān)內(nèi)容谆沃，公眾號【科研后花園】钝凶，主要更新內(nèi)容：1）基于R的科研繪圖；2）科研小技巧分享唁影；3）繪圖技巧分享耕陷；4）科研網(wǎng)站分享。
-
R繪圖|pheatmap熱圖繪制——高階篇
繪圖場景：在高通量檢測數(shù)據(jù)中，我們在數(shù)據(jù)展示上往往都喜歡將感興趣的功能或者通路基因繪制成熱圖形式崔慧，能夠讓讀者一目了然的發(fā)現(xiàn)某功能是增強(qiáng)了拂蝎？還是減弱了？在實(shí)際過程中惶室，表型實(shí)驗(yàn)上...
-
運(yùn)用 R語言 pheatmap 包繪制熱圖進(jìn)階部分pheatmap包來顯示行或列的分組信息 行或列的分組注釋信息 在EXCEL中整理好樣本和物種的注釋信息匣屡，當(dāng)然這個需要依據(jù)你的具體需求來確定。 對樣本的注釋信息拇涤，比如這里用到...
-
-
R繪制熱圖（pheatmap）熱圖可以反應(yīng)各個樣本的基因分布情況也拜，把數(shù)字轉(zhuǎn)換成圖片更直觀一些，目前畫熱圖的軟件不少趾痘，比如graphpad慢哈，華科也出了一款軟件，甚至excel都可以永票，還有很多在線熱圖工具卵贱，但...
-
使用GEMMA進(jìn)行GWAS分析
GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合線性模型的GWAS分析軟件。相比較...
-
用ropls進(jìn)行代謝組PCA, PLS, PLS-DA, OPLS, or OPLS-DA分析簡介 主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是對變量數(shù)超過樣本數(shù)量或變量之間存在多重共線性的組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化旗唁、回歸畦浓、分類和特征選擇的常用方法。 PLS和正交偏最小二乘...
-
R繪圖_熱圖包pheatmappheatmap检疫，全稱Pretty Heatmaps讶请，直譯“完美的熱圖”，是一款非常優(yōu)秀的熱圖繪制R包屎媳。網(wǎng)上也有很多可供參考的教程[1][2]夺溢，在初學(xué)R后，我也曾寫過了一篇教...
-
喜歡編程焙矛、攝影葫盼、美食，去做自己喜歡的事村斟。
-
數(shù)據(jù)處理，分析與展現(xiàn)脱盲，R語言編程邑滨，Python, 圖表制作日缨，基于數(shù)據(jù)的決策與執(zhí)行,算法钱反。Life is short, use Linux.
