單倍型驾讲,是單倍體[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的簡稱,在遺傳學上是指...
繪圖場景:在高通量檢測數(shù)據(jù)中,我們在數(shù)據(jù)展示上往往都喜歡將感興趣的功能或者通路基因繪制成熱圖形式皆的,能夠讓讀者一目了然的發(fā)現(xiàn)某功能是增強了覆履?還是減弱了?在實際過程中费薄,表型實驗上...
pheatmap包來顯示行或列的分組信息 行或列的分組注釋信息 在EXCEL中整理好樣本和物種的注釋信息硝全,當然這個需要依據(jù)你的具體需求來確定。 對樣本的注釋信息楞抡,比如這里用到...
熱圖可以反應各個樣本的基因分布情況先紫,把數(shù)字轉(zhuǎn)換成圖片更直觀一些治泥,目前畫熱圖的軟件不少,比如graphpad遮精,華科也出了一款軟件居夹,甚至excel都可以,還有很多在線熱圖工具本冲,但...
GEMMA(Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm)是一款基于混合線性模型的GWAS分析軟件。相比較...
簡介 主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是對變量數(shù)超過樣本數(shù)量或變量之間存在多重共線性的組學數(shù)據(jù)進行可視化其兴、回歸顶瞒、分類和特征選擇的常用方法。 PLS和正交偏最小二乘...
pheatmap元旬,全稱Pretty Heatmaps榴徐,直譯“完美的熱圖”,是一款非常優(yōu)秀的熱圖繪制R包匀归。網(wǎng)上也有很多可供參考的教程[1][2]坑资,在初學R后,我也曾寫過了一篇教...