R中包的安裝位置默認是在C盤，經常出現C盤不夠用，那我們就需要吧軟件安裝在其他盤中锭环，包括R語言中R。 第一步：首先查看一下自己的安裝位置,一般默認都是在C盤十拣，我們就可以給他的...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
-
R語言中如何更改R包安裝路徑
-
根據免疫細胞浸潤情況鑒定新的預后相關基因特征Identification of a Novel Prognostic Gene Signature From the Immune Cell Infiltration L...
-
跟著Science學作圖：R語言ggplot2散點/連線/95%置信橢圓展示主成分分析結果論文 https://www.science.org/doi/10.1126/science.abk0989[https://www.science.org/doi/10.1...
-
GDSC數據庫使用（分析基因表達量與藥物敏感性影響）
數據下載：不要下載raw data細胞系注釋文件： Cell-line-annotation[ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/project/cance...
-
一文讀懂R語言corrplot相關熱圖分析及美化６荡恰Ｓ啤？淙堋（附圖詳解逸吵，建議收藏）
gzh原文點我，歡迎同時關注[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIwODAxMzc5Mw==&mid=2247489477&idx=1&s...
-
time ROC代碼
一缝裁、繪制符合ggplot2風格的圖片扫皱，可以加theme 1足绅、先定義一個函數，生成timeROC對象韩脑，注意數據集和相應列名需要修改 2氢妈、計算每180天的ROC參數，具體時間可以...
-
臨床生信文章普遍存在的兩個統(tǒng)計問題
臨床預后模型段多，大多包含風險分層和獨立預后分析兩個驗證分析首量，而很多文章在兩個分析上存在不嚴謹。下面介紹一些分析的關鍵點进苍。 1. 風險分層與cutoff 一般而言加缘，預后模型會有訓...
-
跟著 Cell 學作圖 | 復雜熱圖(ComplexHeatmap)今天我們復現一幅2020年發(fā)表在Cell上的熱圖。 DOI:10.1016/j.cell.2020.07.009 22 讀圖 將不同樣本的基因表達情況用熱圖展示并將倍數變化條...
-
文章復現-全外顯子數據分析學習1下載數據教程在：腫瘤外顯子數據處理系列教程（一）讀文獻并且下載測序數據 (qq.com)[https://mp.weixin.qq.com/s/gFd74rOqP56AnyXbllu...
-
傾向性評分(propensity score, PS)
隨機對照實驗是推斷因果關系的金標準觉啊，即通過隨機化過程對所有的基線因素進行平衡拣宏。也就是說，在滿足入選條件的病人中杠人，他們是否接受治療是通過完全隨機化決定的勋乾。 因此觀察到的病人結局...
-
零代碼合并新版TCGA數據庫RNAseq表達譜數據上一期，小編已經給大家分享了如何用R代碼來合并新版TCGA中的RNAseq表達譜數據 ?R代碼合并新版TCGA數據庫RNAseq表達譜數據[https://link.zhih...
-
R語言進行GSEA分析先加載R包 第一步：差異分析 首先是用limma包做差異分析的過程 這里由于做的時候是FPKM數據嗡善，所以參考了生信技能樹的教程： 第二步：獲取基因集 MSigDB可以方便地獲...
-
使用R包ggcorrplot可視化相關矩陣在R中可視化相關矩陣(correlation matrix)的最簡單方法是使用corrplot包辑莫。另一種方法是在ggally包中使用函數ggcorr()。 但是罩引，ggally...
-
m6a甲基化相關基因boxplot并顯示p值m6A甲基化是目前研究的一個熱點摆昧，前面給大家介紹過?m6A甲基化數據分析流程[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixi...
-
R語言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細節(jié)作者：白介素2相關閱讀：R語言ggplot2繪制箱線圖R語言生存分析04-Cox比例風險模型診斷R語言生存分析03-Cox比例風險模型R語言生存分析-02-ggforestR...
-
單細胞測序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程、高級分析蜒程、文章復現
時代的洪流奔涌而至绅你，單細胞技術也從舊時王謝堂前燕，飛入尋常百姓家昭躺。雪崩的時候忌锯，沒有一片雪花是無辜的，你我也從素不相識领炫，到被一起卷入單細胞天地偶垮。R語言和Seurat已以勢如破竹...
-
GDSC數據庫：信號通路和藥物GDSC：Genomics of Drug Sensitivity in Cancer https://www.cancerrxgene.org/[https://www.c...
