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Post-GWAS-LD圖與基因艘蹋，關聯(lián)結果一起可視化IntAssoplot包可以將GWAS結果和LD， 基因結構圖整合在一起畫出。介紹來自：https://github.com/whweve/IntAssoPlot[https...
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繪制 SNP 密度圖一般使用 CMplot 繪制SNP密度圖：包鏈接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要繪制 SNP 密度圖挠他，僅僅需要三列即可：a. 第...
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孟德爾隨機化之MRBase和TwoSample MR PracticalMR Base Overview MR Base是一個用于孟德爾隨機化的在線數據庫以及分析平臺，由Bristol大學的MRC Integrative Epidemiology...
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ImageJ處理共聚焦圖片
ImageJ處理共聚焦圖片 “File” --- “Open” --- 打開文件 --- 不同特殊選擇直接點擊“OK” 調整亮度/對比度：“Image” --- “Adjus...
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表達數量性狀位點（eQTL）的概念及其相關分析
表達數量性狀位點（expression quantitative trait locus, eQTL）是一類能夠影響基因表達量的遺傳位點（大部分都是單核苷酸多態(tài)性，SNP）结执，...
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eQTL 分析eQTL 分析 轉錄組+SNP聯(lián)合分析：Matrix eQTL R包 文獻：Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large m...
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Matrix eQTL分析目前針對QTL分析有很多軟件度陆，比如Plink、 Merlin献幔、R/qtl懂傀、FastMap等等,今天給大家分享一下如何使用Matrix eQTL進行分析。首先我們先了解一下什么...
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eQTL歸納幾篇eQTL相關文章蜡感。 1.轉自https://www.cnblogs.com/Acceptyly/p/3904108.html 首先QTL是數量性狀位點蹬蚁，比如身高是一個...
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傳說中的 “bio生物信息” 首席編輯
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post-GWAS：使用coloc進行共定位分析(Colocalization)
GWAS找到顯著信號位點后缚忧，需要解釋顯著信號位點如何影響表型。常見的一個解釋方法是共定位分析杈笔。 主流的共定位分析包括： 1）GWAS和eQTL共定位闪水； 2）GWAS和sQTL...
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論孟德爾隨機化與單細胞聯(lián)合研究的可能性因為我自己研究的領域跨單細胞球榆、QTL、以及孟德爾隨機化禁筏，所以就一直在思考這個問題：單細胞能不能和孟德爾隨機化聯(lián)合起來研究持钉？ 這方面的文章或者研究比較少。兩個組學能夠聯(lián)合我能想...
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