1米母、安裝并加載部分R包 2悦昵、設(shè)置工作路徑 3错忱、導(dǎo)入表達(dá)譜數(shù)據(jù) 4惩嘉、去除Ensembl_ID小數(shù)點(diǎn)后面的數(shù)字 5摩瞎、下載Homo_sapiens.GRCh38.99.chr.gt...
IP屬地：山東
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二帅涂、UCSC Xena數(shù)據(jù)庫(kù)下載表達(dá)數(shù)據(jù)Ensemble_ID轉(zhuǎn)換為Gene并整理數(shù)據(jù)
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Ferroptosis: mechanisms, biology and role in disease（中）Iron in ferroptosis 從名字本身可以明顯看出吕漂，鐵死亡依賴于鐵亲配。首先，非酶促的惶凝、鐵依賴的芬頓連鎖反應(yīng)可能是鐵死亡的必要條件:當(dāng)GPX4被抑制時(shí)吼虎，PLOOHs可...
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Ferroptosis: mechanisms, biology and role in disease（上）本文選自molecular cell biology 摘要：自2012年該術(shù)語被創(chuàng)造出來以來，在過去的幾年里苍鲜，鐵死亡的研究領(lǐng)域經(jīng)歷了指數(shù)級(jí)的增長(zhǎng)思灰。這種由鐵依賴性磷脂過氧化作用...
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這本對(duì)純生信友好的期刊接收率高達(dá)72%，畢業(yè)黨有希望
今天來介紹一本對(duì)純生信SCI非友好的期刊混滔，而且這本期刊的接收率非常高洒疚，高得驚人呢，接收率高達(dá)72%坯屿，真的令人不敢相信油湖。有人可能會(huì)說小編你就吹牛吧，繼續(xù)吹愿伴。小編才能沒有吹牛呢肺魁，...
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鐵死亡：該何去何從？本文是一篇綜述隔节，選自nature reviews鹅经，單純翻譯，其中的觀點(diǎn)和我不謀而合怎诫，希望可以做出點(diǎn)東西來瘾晃。 摘要：鐵死亡是新近認(rèn)識(shí)到的一種細(xì)胞死亡方式，它在形態(tài)幻妓、生化和基因上...
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搞科研，什么都不配强胰，進(jìn)了實(shí)驗(yàn)室我就是王舱沧，出了實(shí)驗(yàn)室就是舔??一枚，經(jīng)受著社會(huì)在身上不斷的摩擦偶洋，反抗不了熟吏，只能學(xué)著享受。
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轉(zhuǎn)錄組WGCNA分析介紹這個(gè)包之前玄窝，先要搞清楚這個(gè)包能干啥牵寺。（部分內(nèi)容摘抄自學(xué)術(shù)咖） Q1：WGCNA能干嘛？A1：能夠?qū)⒈磉_(dá)模式相似的基因進(jìn)行聚類恩脂，并分析模塊與特定性狀或表型之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系帽氓。具...
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WGCNA實(shí)例分析及解讀（附代碼）WGCNA分析基于兩個(gè)假設(shè)：1.相似表達(dá)模式的基因可能存在共調(diào)控黎休、功能相關(guān)或處于同一通路，2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無尺度分布玉凯》苡妫基于這兩點(diǎn)，可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達(dá)相似性劃分為不同的模塊...
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生信結(jié)合臨床數(shù)據(jù)發(fā)表了32分的SCI有人想看10分以上的SCI壮啊，好的，安排來了撑蒜。這次分享的生信結(jié)合臨床數(shù)據(jù)發(fā)文思路發(fā)表在JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY上歹啼，該期刊的影響因子：32.9，屬...
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無碼生信 | 濕實(shí)驗(yàn)同學(xué)的福音 -GEPIA肖恩打算搜羅現(xiàn)有的提供生物信息相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)座菠、分析網(wǎng)站和工具狸眼，讓不會(huì)代碼的小伙伴們，也能在科研過程中浴滴，享受生物信息學(xué)帶來的高效和風(fēng)騷拓萌。Bioinformatics is cli...
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分析基因和miRNA與疾病表型的相關(guān)性（WGCNA）流程圖： 1.分別下載某個(gè)疾病基因和miRNA的芯片數(shù)據(jù)2.分別進(jìn)行聚類分析（WCGNA） 得到基因以及miRNA聚類模塊與表型的關(guān)系參考：http://www.bio-in...
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R語言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細(xì)節(jié)作者：白介素2相關(guān)閱讀：R語言ggplot2繪制箱線圖R語言生存分析04-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型診斷R語言生存分析03-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型R語言生存分析-02-ggforestR...
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公眾號(hào): 醫(yī)科研<br>wechat: YKY7060
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之前對(duì)R語言和Linux是沒有一點(diǎn)基礎(chǔ)，所以詳細(xì)記錄怎么入門以及如何使用翰撑。R語言應(yīng)用很廣罩旋，知識(shí)很多，生信分析主要常用哪些知識(shí)，牢牢掌握那些知識(shí)點(diǎn)且應(yīng)用熟練涨醋。
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GEO數(shù)據(jù)庫(kù)：GEO2R的簡(jiǎn)單使用今天聽了一節(jié)關(guān)于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的課瓜饥，GEO是什么，又是一頭霧水浴骂，強(qiáng)迫基因受環(huán)境影響出現(xiàn)短暫的表達(dá)乓土，趕緊搜索了解下，GEO（Gene Expression Omnibus dat...
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生物信息；python/R/Shell編程學(xué)習(xí)~<br>生信博士在讀~ wx同號(hào)～
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