1懂从、安裝并加載部分R包 2盐碱、設(shè)置工作路徑 3潘拨、導(dǎo)入表達譜數(shù)據(jù) 4逗嫡、去除Ensembl_ID小數(shù)點后面的數(shù)字 5锦茁、下載Homo_sapiens.GRCh38.99.chr.gt...
IP屬地：山東
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二椭懊、UCSC Xena數(shù)據(jù)庫下載表達數(shù)據(jù)Ensemble_ID轉(zhuǎn)換為Gene并整理數(shù)據(jù)
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Ferroptosis: mechanisms, biology and role in disease（中）Iron in ferroptosis 從名字本身可以明顯看出仑荐，鐵死亡依賴于鐵。首先纵东，非酶促的粘招、鐵依賴的芬頓連鎖反應(yīng)可能是鐵死亡的必要條件:當(dāng)GPX4被抑制時，PLOOHs可...
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Ferroptosis: mechanisms, biology and role in disease（上）本文選自molecular cell biology 摘要：自2012年該術(shù)語被創(chuàng)造出來以來篮迎，在過去的幾年里男图，鐵死亡的研究領(lǐng)域經(jīng)歷了指數(shù)級的增長。這種由鐵依賴性磷脂過氧化作用...
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這本對純生信友好的期刊接收率高達72%甜橱，畢業(yè)黨有希望
今天來介紹一本對純生信SCI非友好的期刊逊笆，而且這本期刊的接收率非常高，高得驚人呢岂傲，接收率高達72%难裆，真的令人不敢相信。有人可能會說小編你就吹牛吧，繼續(xù)吹乃戈。小編才能沒有吹牛呢褂痰，...
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鐵死亡：該何去何從？本文是一篇綜述症虑，選自nature reviews缩歪，單純翻譯，其中的觀點和我不謀而合谍憔，希望可以做出點東西來匪蝙。 摘要：鐵死亡是新近認(rèn)識到的一種細(xì)胞死亡方式，它在形態(tài)习贫、生化和基因上...
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搞科研苫昌，什么都不配颤绕，進了實驗室我就是王，出了實驗室就是舔??一枚祟身，經(jīng)受著社會在身上不斷的摩擦奥务，反抗不了，只能學(xué)著享受月而。
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轉(zhuǎn)錄組WGCNA分析介紹這個包之前汗洒，先要搞清楚這個包能干啥。（部分內(nèi)容摘抄自學(xué)術(shù)咖） Q1：WGCNA能干嘛父款？A1：能夠?qū)⒈磉_模式相似的基因進行聚類溢谤，并分析模塊與特定性狀或表型之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系。具...
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WGCNA實例分析及解讀（附代碼）WGCNA分析基于兩個假設(shè)：1.相似表達模式的基因可能存在共調(diào)控、功能相關(guān)或處于同一通路肝集，2.基因網(wǎng)絡(luò)符合無尺度分布瞻坝。基于這兩點杏瞻，可以將基因網(wǎng)絡(luò)根據(jù)表達相似性劃分為不同的模塊...
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生信結(jié)合臨床數(shù)據(jù)發(fā)表了32分的SCI有人想看10分以上的SCI所刀，好的，安排來了捞挥。這次分享的生信結(jié)合臨床數(shù)據(jù)發(fā)文思路發(fā)表在JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY上浮创，該期刊的影響因子：32.9，屬...
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無碼生信 | 濕實驗同學(xué)的福音 -GEPIA肖恩打算搜羅現(xiàn)有的提供生物信息相關(guān)的數(shù)據(jù)庫砌函、分析網(wǎng)站和工具斩披，讓不會代碼的小伙伴們溜族，也能在科研過程中，享受生物信息學(xué)帶來的高效和風(fēng)騷垦沉。Bioinformatics is cli...
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分析基因和miRNA與疾病表型的相關(guān)性（WGCNA）流程圖： 1.分別下載某個疾病基因和miRNA的芯片數(shù)據(jù)2.分別進行聚類分析（WCGNA） 得到基因以及miRNA聚類模塊與表型的關(guān)系參考：http://www.bio-in...
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R語言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細(xì)節(jié)作者：白介素2相關(guān)閱讀：R語言ggplot2繪制箱線圖R語言生存分析04-Cox比例風(fēng)險模型診斷R語言生存分析03-Cox比例風(fēng)險模型R語言生存分析-02-ggforestR...
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公眾號: 醫(yī)科研<br>wechat: YKY7060
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之前對R語言和Linux是沒有一點基礎(chǔ)诬像，所以詳細(xì)記錄怎么入門以及如何使用。R語言應(yīng)用很廣闸婴，知識很多，生信分析主要常用哪些知識芍躏，牢牢掌握那些知識點且應(yīng)用熟練邪乍。
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GEO數(shù)據(jù)庫：GEO2R的簡單使用今天聽了一節(jié)關(guān)于GEO數(shù)據(jù)庫的課，GEO是什么对竣，又是一頭霧水庇楞，強迫基因受環(huán)境影響出現(xiàn)短暫的表達，趕緊搜索了解下否纬，GEO（Gene Expression Omnibus dat...
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生物信息临燃；python/R/Shell編程學(xué)習(xí)~<br>生信博士在讀~ wx同號～
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