“ 話不多說珍逸，直接開始今天的主題——給大家梳理一下如何通過測序得到的序列獲得最后呈現(xiàn)給讀者的系統(tǒng)發(fā)育樹！” 1、序列準備： 通過測序獲得需要鑒定的目標菌株的序列信息砂沛，一般細菌...
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菌種鑒定——如何構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹 -
2023-03-27系統(tǒng)發(fā)育樹最近在做基因家族分析。拿到了基因家族成員的序列之后谨履，當開始做進化樹時就遇到了些問題笛求，然后就在網(wǎng)上搜索了些教程，和一些網(wǎng)站扭粱。 一舵鳞、首先說一下發(fā)育樹 系統(tǒng)發(fā)育樹（Phylogen...
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一文講完葉綠體基因組比較分析的全部軟件和配套ggplot繪圖腳本前段時間蜓堕，發(fā)表了一篇葉綠體基因組比較分析文章。盡管這類套路文已經(jīng)不再熱門博其，但在準備數(shù)據(jù)分析的過程中套才，仍感各種資料教程之零散，各種文章的做圖工具也是令人眼花繚亂慕淡。故此背伴，列出個人...
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mVISTA學習mVISTA[http://genome.lbl.gov/vista/mvista/submit.shtml]是常用的葉綠體基因組比對圖的繪制程序傻寂，但是輸入文件需要滿足mVI...
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REPuter注釋葉綠體重復序列REPuter可注釋葉綠體重復序列眉孩，包括4種類型个绍，F(xiàn)orward（F）, Reverse (R), Complement (C), Palindromic (P)。 REPu...
