“ 話不多說，直接開始今天的主題——給大家梳理一下如何通過測序得到的序列獲得最后呈現(xiàn)給讀者的系統(tǒng)發(fā)育樹！” 1、序列準(zhǔn)備： 通過測序獲得需要鑒定的目標(biāo)菌株的序列信息，一般細(xì)菌...
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菌種鑒定——如何構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹 -
2023-03-27系統(tǒng)發(fā)育樹最近在做基因家族分析御雕。拿到了基因家族成員的序列之后私股，當(dāng)開始做進(jìn)化樹時就遇到了些問題议街，然后就在網(wǎng)上搜索了些教程割捅，和一些網(wǎng)站奶躯。 一、首先說一下發(fā)育樹 系統(tǒng)發(fā)育樹（Phylogen...
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一文講完葉綠體基因組比較分析的全部軟件和配套ggplot繪圖腳本前段時間，發(fā)表了一篇葉綠體基因組比較分析文章莫瞬。盡管這類套路文已經(jīng)不再熱門儡蔓，但在準(zhǔn)備數(shù)據(jù)分析的過程中，仍感各種資料教程之零散疼邀，各種文章的做圖工具也是令人眼花繚亂喂江。故此，列出個人...
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mVISTA學(xué)習(xí)mVISTA[http://genome.lbl.gov/vista/mvista/submit.shtml]是常用的葉綠體基因組比對圖的繪制程序，但是輸入文件需要滿足mVI...
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REPuter注釋葉綠體重復(fù)序列REPuter可注釋葉綠體重復(fù)序列瓦戚，包括4種類型，F(xiàn)orward（F）, Reverse (R), Complement (C), Palindromic (P)丛塌。 REPu...
