發(fā)簡信
IP屬地：浙江
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基于非m6A相關(guān)新抗原編碼lncRNA特征構(gòu)建膠質(zhì)瘤評分模型Scoring model based on the signature of non-m6A-related neoantigen-coding lncRNAs assis...
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m6A甲基化前沿 表觀遺傳學(xué)忧侧，包括組蛋白共價修飾(covalent histone modification)、DNA甲基化修飾(DNA methylation)震放、RNA甲基化修飾(RN...
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膠質(zhì)瘤綜述1：膠質(zhì)瘤CpG島甲基化表型(G-CIMP):生物學(xué)和臨床意義標題：Glioma CpG island methylator phenotype (G-CIMP): biological and clinical implicatio...
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生信初學(xué)小白凡资，都是學(xué)習(xí)筆記
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基因的啟動子隙赁、UTR垦藏、TSS等區(qū)域基因的pomoter區(qū)域：首先在NCBI中查找基因id，顯示location的位置伞访； 該位置對應(yīng)到轉(zhuǎn)錄水平掂骏，應(yīng)該是從TTS（即5' UTR的起始）； 一般取上游2K長的序列作...
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公號「福傳讀書」專注年輕人“腦袋”和“口袋”那些事滑废！
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DNA甲基化差異的甲基化 差異的甲基化位點位于基因的prometer區(qū)域蝗肪，我們才去保留，主要包括（TSS200和TSS1500） 注釋文件來自ChAMP工具包蠕趁，data一下即可 一般的差...
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努力成為R 極客<br>R和python愛好者<br>bioninfomatics
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已經(jīng)做完GO enrichment,例如david結(jié)果, ggplot2可視化有一些已經(jīng)做完了GO enrichment, 得到了結(jié)果俺陋，才發(fā)現(xiàn)很多軟件都是直接給gene list做富集豁延。如果已經(jīng)完成分析，照樣可以畫圖腊状，代碼如下： 原始文件示例：Anno...
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TBtools | 插件商店（Plugin Store）面世诱咏！寫在前面 TBtools 文稿見刊前后，我釋放了 TBtools 的插件（Plugin）功能缴挖，支持插件安裝和卸載（Ctrl+鼠標點擊）袋狞。而插件的分發(fā)則一直是通過用戶使用交流群...
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看完這篇非腫瘤的生信數(shù)據(jù)挖掘苟鸯，你還會覺得難嗎
請注意了，請注意了棚点，請注意了早处，重要的事情說三次，這篇文章不是n年前的瘫析，而是2020年4月份發(fā)表的砌梆，是非常新的一篇文章默责。 有人抱怨本公眾號天天分享的范文都是腫瘤數(shù)據(jù)挖掘的，就不...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘之m6A發(fā)文思路看到題目咸包，很多人都會覺得這個也太夸張了吧傻丝！老實說，一點也不夸張诉儒，因為有人已經(jīng)按照這個套路發(fā)了好幾篇文章葡缰，只需要把數(shù)據(jù)替換成自己的，然后Ctrl C與Ctrl V代碼即可出來對...
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分享各種各樣的科研日常。
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R語言畫棒棒糖圖（lollipop）展示snp在基因上的位置今天在一個微信群里看見有人問下面兩幅圖用R語言如何實現(xiàn) 第一幅就是散點圖 兩列數(shù)據(jù)x,y用來控制散點的位置温算，一列變量用來映射顏色怜校，F(xiàn)requency用來映射大小。這個實現(xiàn)起來...
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北京生信菜鳥團小站，對應(yīng)菜鳥團VX矩陣巩割。
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更多教程請關(guān)注“生信學(xué)習(xí)者”
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第一個跟著Nature Communications學(xué)畫圖系列合集第一個 跟著Nature Communications學(xué)畫圖 系列 完結(jié)宣谈。涉及到的內(nèi)容包括愈犹，基礎(chǔ)繪圖函數(shù)畫散點圖、基礎(chǔ)繪圖函數(shù)畫箱線圖闻丑、基礎(chǔ)繪圖函數(shù)拼圖漩怎、ggplot2畫散點...
