本文采用GSE7014數(shù)據(jù)集作為示例數(shù)據(jù)集刪除了35-44樣本,僅保留26個樣本進行計算分為T2DM和Control組 首先下載CEl文件和準備Targets文件 第一步提取...
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1. 為什么我們要進行Normalization 測序深度:某些低表達量的基因只有在較高的測序深度時才能檢測到磺送。一般而言驻子,隨著測序深度的增加,基因種類以及可變剪接體的數(shù)目也會...
之前R都是在Windows運行比較多,Rstudio基本滿足數(shù)據(jù)分析和繪圖需求汗销。但是這次通過R進行WGCNA犹褒,基因數(shù)目比較多Windows帶不動,所以轉(zhuǎn)戰(zhàn)Linux弛针。學校的大...
劉小澤寫于19.3.19通常做富集分析時,我們會遇到兩種方法Pathway和GSEA削茁,它們到底有什么區(qū)別宙枷? 前言 我們通過差異分析會得到一些差異基因,那么如何知道這些基因是做...