Venn圖經(jīng)常用于表現(xiàn)組間重疊元素的數(shù)量信息。但是隨著分組數(shù)量的增多盾致，Venn圖的結(jié)構(gòu)會越漸復(fù)雜劳坑，如下所示毕谴，當(dāng)分組數(shù)量為5組時，已經(jīng)不容易從中識別交集概況了距芬。因此涝开，這也是為什...
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Venn圖難以展示大于5組的集合怎么辦苍匆？用UpSet圖表示 -
生信分析中常用的R語句
一、前言 好難受框仔，今天的R崩了舀武、昨天才安裝的包怎么報錯了、為啥我裝了這個包沒反應(yīng)离斩，什么鬼怎么又亂碼了银舱。這玩泥巴(╯‵□′)╯︵┻━┻不行要佛系生活，好久沒寫簡書了跛梗，還是來整理...
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如何防止機(jī)器學(xué)習(xí)模型的過擬合（翻譯筆記）
How to Prevent Overfitting in Machine Learning Models Very deep neural networks with a ...
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R：setwd()與getwd()
在R中我們主要用到的就是setwd()與getwd()這兩個函數(shù)寻馏，來設(shè)置好工作目錄。 1 setwd() 顧名思義核偿，它是原來設(shè)置當(dāng)前工作目錄的诚欠，注意調(diào)用格式為：setwd("...
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公眾號 生信小課堂
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RNA-seq入門實(shí)戰(zhàn)（五）：差異分析——DESeq2 edgeR limma的使用與比較本節(jié)概覽：1.DESeq2轰绵、 edgeR、limma的使用2.三類差異分析軟件的結(jié)果比較——相關(guān)性尼荆、韋恩圖3.選取差異基因繪制火山圖和熱圖 承接前期文章：RNA-seq入門實(shí)...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘入門---什么是TCGA左腔？TCGA中有哪些數(shù)據(jù)？
1. 什么是TCGA捅儒？TCGA中有哪些數(shù)據(jù)液样？ TCGA的全稱是The Cancer Genome Atlas, 這個項(xiàng)目始于2005年，它旨在使用基因測序和生物信息學(xué)編目與癌...
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記錄和分享工作、科研上的技能和方法狞悲！在此之余，也希望能幫到有同樣疑問的小伙伴妇斤！<br>微信公共號：YJY技能修煉<br>特別喜歡的一句話: 生如螻蟻當(dāng)立鴻鵠之志摇锋，命薄似紙應(yīng)有不屈之心丹拯。
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擬時序分析簡要內(nèi)容--擬時序分析的定義--結(jié)果解讀--------做出結(jié)果（cluster、state）--------確定起始點(diǎn)--------做start····end的圖（并且映...
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【生信基礎(chǔ)】深入理解FPKM/TPM荸恕，只有GTF文件如何將count轉(zhuǎn)為FPKM/TPM相信學(xué)習(xí)生信的小伙伴不難發(fā)現(xiàn)乖酬，在定量的時候大多的文章或者公司的結(jié)果都有這幾種定量的方式：FPKM（RPKM），TPM融求，CPM(RPM)還有count等等咬像，這些究竟該如何使用，...
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CRISPR-Cas9基因編輯7--測序驗(yàn)證敲除前言： 使用挑單克隆技術(shù)得到多個單克隆細(xì)胞系后生宛，就要開始驗(yàn)證敲除县昂，除了蛋白表達(dá)水平的檢測，最終還是要看測序結(jié)果陷舅。關(guān)于測序的方案也是各有不同倒彰，由于之前選用的是CRISPR-Ca...
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研究生在讀<br>渣渣學(xué)生在好的學(xué)校里掙扎爭取畢業(yè)中
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當(dāng)在談臨床預(yù)測模型時候待讳，我們究竟在說啥?臨床資料收集： 1.提出科學(xué)問題 2.收集臨床資料 3.選擇合適統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 4.選擇合適的統(tǒng)計(jì)軟件 5.評估結(jié)果，結(jié)合專業(yè)知識回答科學(xué)問題 這個框架真的很好用的仰剿，我在間接性殘...
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STRING數(shù)據(jù)庫的蛋白質(zhì)相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò)分析在轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)的文獻(xiàn)中创淡，我們經(jīng)常能夠看到這樣的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（protein protein interaction network，PPI network）南吮。具體而言辩昆，...
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搞科研汁针，什么都不配，進(jìn)了實(shí)驗(yàn)室我就是王砚尽，出了實(shí)驗(yàn)室就是舔??一枚施无，經(jīng)受著社會在身上不斷的摩擦，反抗不了必孤，只能學(xué)著享受猾骡。
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鐵死亡研究進(jìn)展（四）。
逐漸爆發(fā)的2019年敷搪。 1.敗血癥是一種威脅生命的疾病兴想，由對感染的異常免疫反應(yīng)引起，可導(dǎo)致組織損傷赡勘，器官衰竭和死亡嫂便。Erastin是一種能夠引發(fā)癌細(xì)胞中鐵死亡的小分子。然而闸与，...
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We'll do whatever just to stay alive.
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如何理解Type I/II Error，敏感性與特異性以及ROC厂画，AUC（2019-12-16） 首先凸丸，Type I/II Error 在維基百科的解釋為： Type I error is the rejection of a true null...
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