劉小澤寫于18.10.24最近開始寫第一篇英文小論文宣脉，練練手，為將來寫英文大論文做準備 目錄 1 背景 Background Types of biological netw...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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RNA-seq數(shù)據(jù)的基因共表達網(wǎng)絡分析 -
很不錯允扇，說的很清楚，按著操作也都可以實現(xiàn)则奥。
使用pheatmap包繪制熱圖
加載所需R包 設置工作路徑 構(gòu)建測試數(shù)據(jù)集 將熱圖結(jié)果按聚類后的順序輸出
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pubmed改版了，找不到probe了
用NCBI查找已公布的引物序列糊治，3秒鐘就能帶你完美找到~
ZSCI 1.mRNA引物序列查找 2.lncRNA引物序列查找 注意：用此方法只建議進行 mRNA和lncRNA的基因表達引物查找。 一罚舱、mRNA引物序列查找 步驟都在圖上...
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單細胞數(shù)據(jù)處理小細節(jié)匯總1. Seurat對象查看當前的Assay 在進行了SCTransform操作后，矩陣默認會變成SCT矩陣管闷，如果不加設置，后續(xù)的PCA等操作都是基于SCT矩陣包个。修改Defau...
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
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GEO數(shù)據(jù)上傳的詳細步驟演示GEO數(shù)據(jù)上傳的詳細步驟演示 想必很多老師、同學們對轉(zhuǎn)錄組相關(guān)數(shù)據(jù)如何上傳至GEO數(shù)據(jù)庫存在困惑糯而，本篇整理了GEO數(shù)據(jù)上傳的相關(guān)步驟，教大家如何上傳數(shù)據(jù)熄驼。 1 登錄GEO 1...
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中山大學中山醫(yī)學院-基礎醫(yī)學博士在讀<br>歡迎關(guān)注個人公眾號<br><br>公眾號：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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使用ArchR分析單細胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第十二章)本文首發(fā)于我的個人博客吴叶， http://xuzhougeng.top/ 往期回顧: 使用ArchR分析單細胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第一章) 使用ArchR分析單細胞ATAC-...
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ATAC-seq分析干貨-2
作者 | Arno審稿 | 童蒙編輯 | amethyst 上一期我們介紹了ATAC-seq相關(guān)的背景知識序臂。ATAC-Seq能幫助我們從全基因組范圍內(nèi)推測可能的開放染色質(zhì)位點...
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生信阿拉丁咸灿，為實用而生
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第二章：謀殺之謎寫作基礎
第一個問題是：從哪里開始构订？好吧，讓我們從基礎開始悼瘾。 任何故事的基本結(jié)構(gòu)都需要三個基本階段。它必須有開始审胸，中間和結(jié)束亥宿。這是一個很簡單的概念。雖然我們不是在寫一本謀殺之謎小說（或...
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第一章：使用系統(tǒng)和圖表
本指南中設置的圖表可以以兩種不同的方式使用烫扼。這完全取決于你想用哪種方法或途徑來為你的謀殺之謎構(gòu)造想法和信息。 選項1：你可以閱讀列表或圖表碍庵，在閱讀的過程中簡單地選擇那些能激發(fā)...
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第五章：場景事件
一旦我們確定了故事的主題和大致地點，我們就需要知道為什么有那么多嫌疑人會聚集在一起堰氓，并且在謀殺發(fā)生的時候出現(xiàn)在現(xiàn)場。確定這些信息也有助于為故事情節(jié)增加一些懸念和氛圍苹享。下面的圖...
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第七章：受害人
現(xiàn)在我們要為這個謀殺之謎中最重要的人物創(chuàng)造細節(jié)了。這個人將以一種不正當?shù)姆绞奖粴?否則富稻，玩家就沒有犯罪問題需要解決了掷邦。我猜被殺的人是這個聚會的主人，是莊園的居民椭赋，隨著故事的發(fā)...
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我也通過你文章關(guān)注了，剛開始在基因課上看的他的視頻哪怔，bili沒找到宣蔚，多些up提供了他的名字向抢。
Bioconductor做生信分析入門介紹（上）
這是我聽B站鯪魚不會飛視頻（R與Bioconductor的入門課）里的筆記哦~ Bioconductor是什么？ Bioconductor是一個專門做生信R包的平臺胚委，可以把它...
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簡書是我在學習別人東西的過程中記筆記的地方，以便自己不斷查閱復習硅急，同時通過不斷的輸出來暴露自己的短處從而不斷的進步覆享。大家留言問的問題我都看到了，沒有回復是因為自己學藝不精不能準確答復营袜，望諒解~
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實踐如風凤壁，規(guī)劃如林，熱情如火跪另，堅毅如山
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使用ArchR分析單細胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第五章)本文首發(fā)于我的個人博客拧抖， http://xuzhougeng.top/ 往期回顧: 使用ArchR分析單細胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第一章) 使用ArchR分析單細胞ATAC-...
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使用ArchR分析單細胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第十一章)本文首發(fā)于我的個人博客罚斗， http://xuzhougeng.top/ 往期回顧: 使用ArchR分析單細胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第一章) 使用ArchR分析單細胞ATAC-...
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conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過conda安裝，省去了很多的安裝针姿、修bug的煩惱袱吆。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件，conda一行命令就搞定了距淫。前兩天有個胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...
