劉小澤寫(xiě)于18.10.24最近開(kāi)始寫(xiě)第一篇英文小論文，練練手，為將來(lái)寫(xiě)英文大論文做準(zhǔn)備 目錄 1 背景 Background Types of biological netw...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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RNA-seq數(shù)據(jù)的基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析 -
很不錯(cuò)，說(shuō)的很清楚潘懊，按著操作也都可以實(shí)現(xiàn)。
使用pheatmap包繪制熱圖
加載所需R包 設(shè)置工作路徑 構(gòu)建測(cè)試數(shù)據(jù)集 將熱圖結(jié)果按聚類(lèi)后的順序輸出
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pubmed改版了，找不到probe了
用NCBI查找已公布的引物序列蜘渣，3秒鐘就能帶你完美找到~
ZSCI 1.mRNA引物序列查找 2.lncRNA引物序列查找 注意：用此方法只建議進(jìn)行 mRNA和lncRNA的基因表達(dá)引物查找。 一肺然、mRNA引物序列查找 步驟都在圖上...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)處理小細(xì)節(jié)匯總1. Seurat對(duì)象查看當(dāng)前的Assay 在進(jìn)行了SCTransform操作后蔫缸，矩陣默認(rèn)會(huì)變成SCT矩陣，如果不加設(shè)置际起，后續(xù)的PCA等操作都是基于SCT矩陣拾碌。修改Defau...
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不看私信<br>看不到的文章是被簡(jiǎn)書(shū)鎖了
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GEO數(shù)據(jù)上傳的詳細(xì)步驟演示GEO數(shù)據(jù)上傳的詳細(xì)步驟演示 想必很多老師校翔、同學(xué)們對(duì)轉(zhuǎn)錄組相關(guān)數(shù)據(jù)如何上傳至GEO數(shù)據(jù)庫(kù)存在困惑，本篇整理了GEO數(shù)據(jù)上傳的相關(guān)步驟灾前，教大家如何上傳數(shù)據(jù)防症。 1 登錄GEO 1...
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中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)<br><br>公眾號(hào)：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第十二章)本文首發(fā)于我的個(gè)人博客蔫敲， http://xuzhougeng.top/ 往期回顧: 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第一章) 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-...
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ATAC-seq分析干貨-2
作者 | Arno審稿 | 童蒙編輯 | amethyst 上一期我們介紹了ATAC-seq相關(guān)的背景知識(shí)。ATAC-Seq能幫助我們從全基因組范圍內(nèi)推測(cè)可能的開(kāi)放染色質(zhì)位點(diǎn)...
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生信阿拉丁，為實(shí)用而生
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第二章：謀殺之謎寫(xiě)作基礎(chǔ)
第一個(gè)問(wèn)題是：從哪里開(kāi)始础嫡？好吧指么，讓我們從基礎(chǔ)開(kāi)始。 任何故事的基本結(jié)構(gòu)都需要三個(gè)基本階段榴鼎。它必須有開(kāi)始伯诬，中間和結(jié)束。這是一個(gè)很簡(jiǎn)單的概念巫财。雖然我們不是在寫(xiě)一本謀殺之謎小說(shuō)（或...
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第一章：使用系統(tǒng)和圖表
本指南中設(shè)置的圖表可以以?xún)煞N不同的方式使用盗似。這完全取決于你想用哪種方法或途徑來(lái)為你的謀殺之謎構(gòu)造想法和信息。 選項(xiàng)1：你可以閱讀列表或圖表平项，在閱讀的過(guò)程中簡(jiǎn)單地選擇那些能激發(fā)...
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第五章：場(chǎng)景事件
一旦我們確定了故事的主題和大致地點(diǎn)赫舒，我們就需要知道為什么有那么多嫌疑人會(huì)聚集在一起悍及，并且在謀殺發(fā)生的時(shí)候出現(xiàn)在現(xiàn)場(chǎng)。確定這些信息也有助于為故事情節(jié)增加一些懸念和氛圍接癌。下面的圖...
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第七章：受害人
現(xiàn)在我們要為這個(gè)謀殺之謎中最重要的人物創(chuàng)造細(xì)節(jié)了心赶。這個(gè)人將以一種不正當(dāng)?shù)姆绞奖粴?否則，玩家就沒(méi)有犯罪問(wèn)題需要解決了缺猛。我猜被殺的人是這個(gè)聚會(huì)的主人缨叫，是莊園的居民，隨著故事的發(fā)...
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我也通過(guò)你文章關(guān)注了荔燎，剛開(kāi)始在基因課上看的他的視頻耻姥，bili沒(méi)找到，多些up提供了他的名字有咨。
Bioconductor做生信分析入門(mén)介紹（上）
這是我聽(tīng)B站鯪魚(yú)不會(huì)飛視頻（R與Bioconductor的入門(mén)課）里的筆記哦~ Bioconductor是什么琐簇？ Bioconductor是一個(gè)專(zhuān)門(mén)做生信R包的平臺(tái)，可以把它...
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簡(jiǎn)書(shū)是我在學(xué)習(xí)別人東西的過(guò)程中記筆記的地方纵装，以便自己不斷查閱復(fù)習(xí)征讲，同時(shí)通過(guò)不斷的輸出來(lái)暴露自己的短處從而不斷的進(jìn)步。大家留言問(wèn)的問(wèn)題我都看到了橡娄，沒(méi)有回復(fù)是因?yàn)樽约簩W(xué)藝不精不能準(zhǔn)確答復(fù)诗箍，望諒解~
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實(shí)踐如風(fēng)滤祖，規(guī)劃如林，熱情如火瓶籽，堅(jiān)毅如山
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使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第五章)本文首發(fā)于我的個(gè)人博客匠童， http://xuzhougeng.top/ 往期回顧: 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第一章) 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-...
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使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第十一章)本文首發(fā)于我的個(gè)人博客， http://xuzhougeng.top/ 往期回顧: 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)(第一章) 使用ArchR分析單細(xì)胞ATAC-...
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conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過(guò)conda安裝塑顺，省去了很多的安裝汤求、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件严拒，conda一行命令就搞定了扬绪。前兩天有個(gè)胖友問(wèn)我gatk 3.8的版本在哪里...
