寫在前面 其實很多作者已經(jīng)探索的差不多了政钟，相關(guān)腳本诵闭、教程也很多，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧诽凌。有時候感覺是浪費時間洒缀，但是在寫的時候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識米死，不斷記錄反思，也...
IP屬地：上海
-
生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級分析+多組學(xué)分析 -
我要偷偷內(nèi)卷氏义，然后驚艷所有人！
-
ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)訓(xùn)練（二）
ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)訓(xùn)練（二） 四图云、過濾 raw data -> fastqc 使用trim_galore軟件進行質(zhì)控惯悠，過濾 過濾后的文件如下： clean data...
-
生信小白成長記
-
ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)訓(xùn)練（三）ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)訓(xùn)練（三） 六克婶、合并bam文件 在進行peaks calling的時候，需要把bam進行合并丹泉。 得到全新的bam文件如下： 假如需要去除PCR重...
-
ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)訓(xùn)練（一）ChIP-seq數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)訓(xùn)練（一） 一情萤、安裝軟件（conda） 二、下載數(shù)據(jù) 參考文獻 Brookes, E. et al. Polycomb associates ge...
-
本賬戶只是個人的學(xué)習(xí)記錄。防止遺忘睬塌。
-
公眾號：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研揩晴，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組、腫瘤免疫贪磺、單細胞組學(xué)
-
-
Linux命令萬字總結(jié)寒锚，帶你實現(xiàn)基礎(chǔ)Linux命令自由前言 Linux系統(tǒng)的基本操作劫映，對于大多數(shù)計算機類相關(guān)學(xué)生或者相關(guān)從業(yè)人員都很重要，本文以樹莓派的Linux系統(tǒng)為實例刹前，從基礎(chǔ)出發(fā)泳赋，詳細介紹Linux系統(tǒng)中最基礎(chǔ)的操作。 什...
-
PhD student in Biology | Genomics | Evolution | TSS | python | R | Machine Learning | R package develop<br>
-
conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過conda安裝，省去了很多的安裝拣技、修bug的煩惱千诬。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件，conda一行命令就搞定了膏斤。前兩天有個胖友問我gatk 3.8的版本在哪里...
-
-
這里是佳奧<br><br>有疑問歡迎email或yuque平臺<br><br>專注多組學(xué)挖掘基因毅访，以及非模式植物的下游注釋以及可視化工作
-
ChIP-seq（二）：數(shù)據(jù)下載，過濾盘榨，比對1數(shù)據(jù)獲得 2 格式轉(zhuǎn)換 3 質(zhì)控 主要是看是否有接頭序列 4. 去除接頭 接頭序列：GATCGGAAGAGCGGTTCAGCAGGAATGCCGAG 去除完接頭最好再次質(zhì)控...
