比對(duì)結(jié)果有缺失解总,RSEM不能定量
bowtie2比對(duì): Index索引構(gòu)建(hg38, rRNA, mito, spike in)常見(jiàn)的序列比對(duì)工具有很多懦底,如blast鲜屏、hisat2吱抚、bowtie2俺陋、bwa逛绵、STAR等怀各。每個(gè)工具都有其自身的優(yōu)點(diǎn),但同時(shí)也具備了一些缺點(diǎn)术浪。 bowtie適合長(zhǎng)度在50b長(zhǎng)度...
歡迎批評(píng)指正 一、上游處理流程 上游處理步驟包括質(zhì)量檢測(cè)寿酌、質(zhì)量控制胰苏、比對(duì)、定量[2]醇疼,每一步處理數(shù)據(jù)的目的都是不同硕并,也有相關(guān)的軟件與之對(duì)應(yīng)。通過(guò)質(zhì)量檢測(cè)秧荆,原始數(shù)據(jù)的各種問(wèn)題將...