比對(duì)結(jié)果有缺失,RSEM不能定量
bowtie2比對(duì): Index索引構(gòu)建(hg38, rRNA, mito, spike in)常見(jiàn)的序列比對(duì)工具有很多贪庙,如blast道逗、hisat2拇舀、bowtie2变抽、bwa、STAR等掠抬。每個(gè)工具都有其自身的優(yōu)點(diǎn)吼野,但同時(shí)也具備了一些缺點(diǎn)。 bowtie適合長(zhǎng)度在50b長(zhǎng)度...
歡迎批評(píng)指正 一两波、上游處理流程 上游處理步驟包括質(zhì)量檢測(cè)瞳步、質(zhì)量控制、比對(duì)腰奋、定量[2]谚攒,每一步處理數(shù)據(jù)的目的都是不同,也有相關(guān)的軟件與之對(duì)應(yīng)氛堕。通過(guò)質(zhì)量檢測(cè),原始數(shù)據(jù)的各種問(wèn)題將...