列舉了19個(gè)OrgDB莲趣，物種對(duì)應(yīng)的全基因組注釋R包崭孤，方便根據(jù)EntreZ進(jìn)行基因的注釋分析等等 | 物種 | OrgDB || 按蚊（Anopheles） | org.Ag....
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山西
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常見(jiàn)的OrgDB包灌诅，方便對(duì)應(yīng)物種注釋
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跟著Nature ecology and evolution學(xué)python：vcf文件轉(zhuǎn)換成fasta文件論文 A polar bear paleogenome reveals extensive ancient gene flow from polar bears into b...
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Ribo-seq實(shí)驗(yàn)總結(jié)
Ribosome profiling是一種新出現(xiàn)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)，它結(jié)合了高通量測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用沛膳，可以在全基因組水平上監(jiān)測(cè)蛋白質(zhì)的翻譯水平，給研究細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的翻譯調(diào)控機(jī)制帶來(lái)了新的...
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跟著Nature Metabolism學(xué)作圖:R語(yǔ)言ggplot2分組折線圖添加誤差線論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specif...
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生信 | 生信人搭建數(shù)據(jù)庫(kù)的學(xué)習(xí)流程
寫(xiě)在前面 目前各種組學(xué)培訓(xùn)開(kāi)展的如火如荼，卻鮮有生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)搭建的相關(guān)教程和學(xué)習(xí)流程蝶棋。原因有以下幾個(gè)： 1.學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)庫(kù)的搭建付出多，回報(bào)少忽妒。有這功夫應(yīng)該可以把大部分組學(xué)知...
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2021-08-22 tRNA m7G修飾促進(jìn)腫瘤轉(zhuǎn)化??tRNA作為蛋白質(zhì)翻譯中氨基酸的轉(zhuǎn)運(yùn)小能手玩裙，發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。而另一個(gè)有關(guān)tRNA的特殊之處在于其及其豐富的修飾數(shù)量與類(lèi)型段直。一個(gè)成熟的tRNA僅約72nt吃溅，平均每個(gè)t...
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12-19 利用高通量tRNA測(cè)序和調(diào)控分析描繪微生物組群特征Microbiome characterization by high-throughput transfer RNA sequencing and modification...
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2021-04-20 各種tRNA測(cè)序方法tRNA相關(guān)研究似乎由于近些年tsRNA的發(fā)現(xiàn)才又引起大家的關(guān)注，另一個(gè)原因可能也與當(dāng)前RNA表觀遺傳研究相關(guān)鸯檬。 tRNA作為生物體內(nèi)修飾最為豐富的RNA决侈，加上其本身容易形成...
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STAR和PIPE-CLIP對(duì)clip-seq數(shù)據(jù)call peak突變率極低的bug搗鼓兩天才搞明白的bug： bug1表現(xiàn)形式： 1 clip-seq數(shù)據(jù)突變比率嚴(yán)重下講 2 缺失substitution和deletion類(lèi)型的...
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正則表達(dá)式神器神器一：我恨正則表達(dá)式 正如這個(gè)神器的名稱(chēng)所描述的，作者正是痛恨正則表達(dá)式喧务，然后就自己開(kāi)發(fā)了一個(gè)網(wǎng)站赖歌，可以搜索出大部分常見(jiàn)的正則表達(dá)式的寫(xiě)法绿满。 技術(shù)人嘛麻汰，能自己動(dòng)手的決不瞎 ...
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一文讀懂環(huán)狀RNA環(huán)狀RNA的定義是什么？ circRNAs（Circular RNAs酌呆，環(huán)形RNA分子）是一類(lèi)不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴衡载、并以共價(jià)鍵形成環(huán)形結(jié)構(gòu)的非編...
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R Shiny 進(jìn)階.1 多頁(yè)面排版和自定義圖形主題學(xué)習(xí)本章會(huì)解鎖新技能。如何布局layout隙袁。 1. 單頁(yè)面 1.1 頁(yè)面功能 fluidPage()[https://rdrr.io/pkg/shiny/man/fluidP...
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具有Shiny和數(shù)據(jù)庫(kù)的企業(yè)級(jí)儀表板在企業(yè)內(nèi)部痰娱，儀表板應(yīng)該具有最新信息弃榨，盡管有大量數(shù)據(jù)支持它，但在任何設(shè)備上都可以獲得快速響應(yīng)時(shí)間梨睁。最終用戶可能希望單擊圖中的條形圖或列將導(dǎo)致更詳細(xì)的報(bào)告或構(gòu)成該編號(hào)的實(shí)際記錄列...
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網(wǎng)絡(luò)-visNetwork包繪制炫酷的動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò)圖visNetwork是一個(gè)用于網(wǎng)絡(luò)可視化的R包鲸睛，使用的是vis.js javascript庫(kù)(http://visjs.org[http://visjs.org])。visN...
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打包你的腳本坡贺，做成個(gè)有圖形界面的程序吧官辈！最近想把一個(gè)寫(xiě)的幾百行的腳本封裝成一個(gè)App，方便使用遍坟，于是進(jìn)行了一番探索拳亿，在這里記錄一下！ 方案選擇 首先是搜索有哪幾種解決方案愿伴，哪個(gè)是最好的呢肺魁。搜索下來(lái)發(fā)現(xiàn)，有這么幾種：...
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在raw data boxplot前倒下的多天以后爬到了PCAFanta sea, totally shiny-seq 復(fù)現(xiàn) https://www.rna-seqblog.com/shiny-seq-advanced-guided-t...
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盤(pán)點(diǎn)強(qiáng)大的shinyUI美化包從前只知道shiny和shinydashboard隔节，開(kāi)發(fā)簡(jiǎn)單的網(wǎng)頁(yè)是夠的鹅经，但一旦對(duì)顏值有了要求，就不能對(duì)html和css絲毫不知官帘。關(guān)于shiny與CSS：https://sh...