列舉了19個OrgDB衷掷，物種對應的全基因組注釋R包矛辕，方便根據EntreZ進行基因的注釋分析等等 | 物種 | OrgDB || 按蚊（Anopheles） | org.Ag....
發(fā)簡信
IP屬地：江西
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常見的OrgDB包漠畜，方便對應物種注釋
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跟著Nature ecology and evolution學python：vcf文件轉換成fasta文件論文 A polar bear paleogenome reveals extensive ancient gene flow from polar bears into b...
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Ribo-seq實驗總結
Ribosome profiling是一種新出現的實驗技術呢铆，它結合了高通量測序技術的應用，可以在全基因組水平上監(jiān)測蛋白質的翻譯水平，給研究細胞內蛋白質的翻譯調控機制帶來了新的...
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跟著Nature Metabolism學作圖:R語言ggplot2分組折線圖添加誤差線論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specif...
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生信 | 生信人搭建數據庫的學習流程
寫在前面 目前各種組學培訓開展的如火如荼，卻鮮有生物信息學數據庫搭建的相關教程和學習流程锭亏。原因有以下幾個： 1.學習數據庫的搭建付出多，回報少硬鞍。有這功夫應該可以把大部分組學知...
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2021-08-22 tRNA m7G修飾促進腫瘤轉化??tRNA作為蛋白質翻譯中氨基酸的轉運小能手慧瘤，發(fā)揮著至關重要的作用。而另一個有關tRNA的特殊之處在于其及其豐富的修飾數量與類型固该。一個成熟的tRNA僅約72nt锅减，平均每個t...
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12-19 利用高通量tRNA測序和調控分析描繪微生物組群特征Microbiome characterization by high-throughput transfer RNA sequencing and modification...
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2021-04-20 各種tRNA測序方法tRNA相關研究似乎由于近些年tsRNA的發(fā)現才又引起大家的關注，另一個原因可能也與當前RNA表觀遺傳研究相關伐坏。 tRNA作為生物體內修飾最為豐富的RNA怔匣，加上其本身容易形成...
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STAR和PIPE-CLIP對clip-seq數據call peak突變率極低的bug搗鼓兩天才搞明白的bug： bug1表現形式： 1 clip-seq數據突變比率嚴重下講 2 缺失substitution和deletion類型的...
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一文讀懂環(huán)狀RNA環(huán)狀RNA的定義是什么？ circRNAs（Circular RNAs玉工，環(huán)形RNA分子）是一類不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴羽资、并以共價鍵形成環(huán)形結構的非編...
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R Shiny 進階.1 多頁面排版和自定義圖形主題學習本章會解鎖新技能。如何布局layout遵班。 1. 單頁面 1.1 頁面功能 fluidPage()[https://rdrr.io/pkg/shiny/man/fluidP...
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具有Shiny和數據庫的企業(yè)級儀表板在企業(yè)內部屠升，儀表板應該具有最新信息，盡管有大量數據支持它狭郑，但在任何設備上都可以獲得快速響應時間腹暖。最終用戶可能希望單擊圖中的條形圖或列將導致更詳細的報告或構成該編號的實際記錄列...
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網絡-visNetwork包繪制炫酷的動態(tài)網絡圖visNetwork是一個用于網絡可視化的R包，使用的是vis.js javascript庫(http://visjs.org[http://visjs.org])翰萨。visN...
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打包你的腳本脏答，做成個有圖形界面的程序吧！最近想把一個寫的幾百行的腳本封裝成一個App亩鬼，方便使用殖告，于是進行了一番探索，在這里記錄一下雳锋！ 方案選擇 首先是搜索有哪幾種解決方案丛肮，哪個是最好的呢。搜索下來發(fā)現魄缚，有這么幾種：...
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在raw data boxplot前倒下的多天以后爬到了PCAFanta sea, totally shiny-seq 復現 https://www.rna-seqblog.com/shiny-seq-advanced-guided-t...
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盤點強大的shinyUI美化包從前只知道shiny和shinydashboard宝与，開發(fā)簡單的網頁是夠的，但一旦對顏值有了要求冶匹，就不能對html和css絲毫不知习劫。關于shiny與CSS：https://sh...