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1. 原理介紹 官網(wǎng)：https://github.com/immunogenomics/harmony[https://github.com/immunogenomics/...

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一贪庙、seurat執(zhí)行差異表達(dá)分析 根據(jù)單細(xì)胞數(shù)據(jù)預(yù)處理的方式不同（lognormalize和sctransform）糯耍，執(zhí)行差異表達(dá)分析代碼有所不同抓半，這個(gè)需要注意喂急。我當(dāng)時(shí)請(qǐng)教過...

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satijalabsctransform包的github網(wǎng)址：https://github.com/ChristophH/sctransform[https://github...

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1. 學(xué)習(xí)目標(biāo) 討論為什么歸一化計(jì)數(shù)對(duì)于細(xì)胞之間的準(zhǔn)確比較是必要的 解釋如何通過主成分分析 (PCA) 評(píng)估細(xì)胞之間的相似性 在獲得高質(zhì)量單細(xì)胞后，scRNA-seq分析工作...

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了解PCA降維原理的同志們探入，一定都知道PCA的核心是在數(shù)據(jù)的高維空間里面狡孔，尋找出合適的一組向量（向量之間相互正交），并利用這一組向量作為新坐標(biāo)系的基底蜂嗽，使得高維空間的數(shù)據(jù)點(diǎn)投...

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前言 想要白嫖子宮內(nèi)膜癌的單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)用來做驗(yàn)證植旧，搜到一篇做的很全面的單測(cè)文章辱揭，但作者上傳的是SRA文件，只好拾起3年前跟生信技能樹曾老師啟蒙的上游數(shù)據(jù)分析技能病附。 網(wǎng)上一頓...

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寫在前面 其實(shí)很多作者已經(jīng)探索的差不多了较剃，相關(guān)腳本咕别、教程也很多技健，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧写穴。有時(shí)候感覺是浪費(fèi)時(shí)間，但是在寫的時(shí)候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識(shí)雌贱，不斷記錄反思啊送，也...

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兩種都是由于windows和Mac的機(jī)型問題 Mac機(jī)型解決方案： 用allowWGCNAThreads() 替換 enableWGCNAThreads()

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網(wǎng)絡(luò)爬蟲（web crawler）降传，也叫網(wǎng)絡(luò)蜘蛛（spider）篷朵，是一種用來自動(dòng)瀏覽萬維網(wǎng)的網(wǎng)絡(luò)機(jī)器人。其目的一般為編纂網(wǎng)絡(luò)索引婆排。各大搜索引擎都可以被看做爬蟲声旺，根據(jù)爬取的內(nèi)容...