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  • Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq測序指南

    Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq測序指南 github鏈接:harvardinformatics/ATAC-seq 參考文獻(xiàn):ATAC-s...

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    edgeR差異基因分析的一般過程

    基于轉(zhuǎn)錄組測序獲得的定量表達(dá)值,識別差異表達(dá)變化的基因或其它非編碼RNA分子,實(shí)際上方法還是非常多的棘伴。但就目前來看,DESeq2和edgeR是出現(xiàn)頻率最高的兩種方法了。 DE...

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    使用clusterProfiler進(jìn)行GO驶悟、KEGG富集分析(有參情況)

    尋找差異表達(dá)的基因并識別它們的功能,是我們進(jìn)行RNA測序的最主要目的材失。很明顯痕鳍,這些差異的基因必然與功能改變密切相關(guān),例如龙巨,比較患病個體與正常個體的組織表達(dá)譜笼呆,不難想到這些顯著...

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    轉(zhuǎn)錄組測序原理

    參考: https://www.bilibili.com/video/BV1XJ411r7bJ/?spm_id_from=333.788.videocard.0 定義 而轉(zhuǎn)錄...

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    RNAseq005 轉(zhuǎn)錄組入門(5):序列比對

    1 比對的目的 1.1 差異表達(dá)基因只需要確定不同的read計數(shù)洪碳,可以用bowtie, bwa這類比對工具,或者是salmon這類align-free工具奥喻,并且后者的速度更快...

  • RNA-Seq數(shù)據(jù)分析:cutadapt+hisat2+samtools+stringtie+deseq2

    參考教程: Griffith Lab tutorial[https://rnabio.org/course/] raw data/PF data/Q30 data/clean...

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    如何優(yōu)雅地做出高逼格的Western Blot?

    Western Blot(WB)魏颓,蛋白免疫印跡法岭辣,一句話,定性甸饱、定量檢測蛋白表達(dá)的一種經(jīng)典易结、有效的技術(shù)方法。 將電泳分離的細(xì)胞或組織蛋白轉(zhuǎn)移到PVDF膜上柜候,用特定抗體結(jié)合蛋白...

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    解讀CUT&Tag

    CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells 原文:https:/...

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