Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq測序指南 github鏈接:harvardinformatics/ATAC-seq 參考文獻(xiàn):ATAC-s...
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Harvard FAS Informatics出品的ATAC-seq測序指南 github鏈接:harvardinformatics/ATAC-seq 參考文獻(xiàn):ATAC-s...
基于轉(zhuǎn)錄組測序獲得的定量表達(dá)值畅蹂,識別差異表達(dá)變化的基因或其它非編碼RNA分子褪测,實際上方法還是非常多的窿侈。但就目前來看,DESeq2和edgeR是出現(xiàn)頻率最高的兩種方法了括勺。 DE...
尋找差異表達(dá)的基因并識別它們的功能,是我們進(jìn)行RNA測序的最主要目的吱七。很明顯,這些差異的基因必然與功能改變密切相關(guān)鹤竭,例如踊餐,比較患病個體與正常個體的組織表達(dá)譜,不難想到這些顯著...
參考: https://www.bilibili.com/video/BV1XJ411r7bJ/?spm_id_from=333.788.videocard.0 定義 而轉(zhuǎn)錄...
1 比對的目的 1.1 差異表達(dá)基因只需要確定不同的read計數(shù)臀稚,可以用bowtie, bwa這類比對工具吝岭,或者是salmon這類align-free工具,并且后者的速度更快...
參考教程: Griffith Lab tutorial[https://rnabio.org/course/] raw data/PF data/Q30 data/clean...
Western Blot(WB)窜管,蛋白免疫印跡法,一句話撮执,定性微峰、定量檢測蛋白表達(dá)的一種經(jīng)典、有效的技術(shù)方法抒钱。 將電泳分離的細(xì)胞或組織蛋白轉(zhuǎn)移到PVDF膜上蜓肆,用特定抗體結(jié)合蛋白...
CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells 原文:https:/...