@千萬(wàn)別加香菜 好的 謝謝
2024-09-05 | ggplot繪制曼哈頓圖----受夠了有些包的自定義限制整體腳本如下止毕，需要你的文件包含CHR BP P三列魄健，無(wú)所謂順序酝润，也無(wú)所謂有啥其他列怕品，只要有這三列即可 結(jié)果如下
發(fā)簡(jiǎn)信
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請(qǐng)問累計(jì)基因組位置的mutate(chr_cumsum = cumsum(c(0, head(chr_lengths$chr_len, -1)))[CHR]) 這一步是什么意思？
2024-09-05 | ggplot繪制曼哈頓圖----受夠了有些包的自定義限制
整體腳本如下到千，需要你的文件包含CHR BP P三列包晰，無(wú)所謂順序，也無(wú)所謂有啥其他列演侯，只要有這三列即可 結(jié)果如下
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請(qǐng)問這個(gè)run_pipeline.pl腳本在哪姿染？
格式轉(zhuǎn)換--2024-03-23
格式轉(zhuǎn)換hapmap格式：hmp.txtplink格式：ped和map以及二進(jìn)制文件bed/bim/famvcf格式：vcf 1. hapmap <-> vcf hapm...
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格式轉(zhuǎn)換--2024-03-23
格式轉(zhuǎn)換hapmap格式：hmp.txtplink格式：ped和map以及二進(jìn)制文件bed/bim/famvcf格式：vcf 1. hapmap <-> vcf hapm...
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— ggplot 直方圖與密度圖1. 直方圖 直方圖是將單個(gè)變量分隔成若干個(gè)區(qū)間橄仆，并對(duì)區(qū)間內(nèi)的觀測(cè)值進(jìn)行計(jì)數(shù)剩膘。 geom_histogram 函數(shù)可用于繪制直方圖， 而它的變體 geom_freqpoly ...
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安裝軟件盆顾、conda的重新安裝及其使用
一怠褐、軟件安裝 軟件安裝可以參考Jimmy寫的軟件的安裝代碼：生物信息學(xué)常見1000個(gè)軟件的安裝代碼！http://www.biotrainee.com/thread-856-...
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59本R語(yǔ)言相關(guān)參考書椎扬，大部分都可以找到pdf下載https://www.routledge.com/Chapman--HallCRC-The-R-Series/book-series/CRCTHERSER?pd=publi...
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R語(yǔ)言：reshape2-長(zhǎng)寬格式轉(zhuǎn)換之melt()和dcast()函數(shù)
1.前言 melt() 是 reshape2包中的一個(gè)函數(shù)惫搏，它用于將數(shù)據(jù)框從“寬格式（wide format）”轉(zhuǎn)換為“長(zhǎng)格式（long format）”。 寬格式指的是一列...
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R語(yǔ)言做生信，包括數(shù)據(jù)可視化揖铜、數(shù)據(jù)分析茴丰，數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換等。
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數(shù)據(jù)處理，分析與展現(xiàn)龄寞，R語(yǔ)言編程汰规，Python, 圖表制作，基于數(shù)據(jù)的決策與執(zhí)行,算法物邑。Life is short, use Linux.
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為什么我按照一樣的代碼畫出來的y軸溜哮，不是個(gè)每個(gè)bin的個(gè)數(shù)滔金，是比例呢？
ggplot,geom_histogram畫直方圖
所用R 包 ggplot2 數(shù)據(jù)： 最終效果： 代碼 分步說明： 一茂嗓、指定數(shù)據(jù)集 告訴ggplot要以phynotype這個(gè)表格畫圖餐茵，把RSRDS列作為x軸； 二述吸、畫圖類型為...
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Python | 讀取Fasta序列（讀取一個(gè)和讀取多個(gè)）新建一個(gè)字典忿族，將序列信息讀進(jìn)去，這個(gè)代碼的缺陷就是只能讀一個(gè)蝌矛，到第二個(gè)就停止了 接下來的這個(gè)代碼是可以讀取多個(gè)序列
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RNA-seq入門實(shí)戰(zhàn)（十一）：WGCNA加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析——關(guān)聯(lián)基因模塊與表型本節(jié)概覽1. WGCNA基本概念：定義道批、關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)、基本流程入撒、一些注意事項(xiàng)2. WGCNA運(yùn)行：?輸入數(shù)據(jù)準(zhǔn)備①判斷數(shù)據(jù)質(zhì)量屹徘，繪制樣品的系統(tǒng)聚類樹②挑選最佳閾值power③ 構(gòu)...
