你好臂痕，你解決這個(gè)問(wèn)題了嗎
生信基因功能分析工具：Orthofinder使用教程最近Orthofinder2開(kāi)始陸續(xù)更新全蝶，文章已經(jīng)投發(fā)到biorkix上，在網(wǎng)上搜了一圈，關(guān)于Orthofinder的使用的中文教程幾乎是空白的颠通，這周就借此機(jī)會(huì)和大家一起來(lái)學(xué)...
IP屬地：河北
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同問(wèn)险污，哥們兒你解決了嗎？
2019-10-31OrthoFinder-----準(zhǔn)確推斷直系同源物憎瘸、直系同源群入篮、有根物種和基因樹(shù)、基因復(fù)制事件(一)
注：圖簡(jiǎn)單介紹 Proteomes：有三個(gè)物種幌甘，每個(gè)方框內(nèi)的存在旁系同源(存在于一個(gè)物種中潮售，因基因復(fù)制而被區(qū)分開(kāi)，且功能發(fā)生改變)(圖中體現(xiàn)為形狀不一樣)锅风，不同方框之間存在直...
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大佬酥诽，我想問(wèn)一下這個(gè)軟件能算出一個(gè)物種里旁系同源有多少組?duplication events里面species end的duplicated gene是旁系同源么？
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基礎(chǔ)知識(shí) — Exons,Introns,ORF,CDS,UTR,lncRNA,轉(zhuǎn)錄本,可變剪切,密碼子,啟動(dòng)子,順式調(diào)控元件,轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),終止子,轉(zhuǎn)錄因子,結(jié)構(gòu)基因1.核酸边器，基因训枢，DNA，染色體饰抒，基因組肮砾，同源染色體，等位基因 核酸袋坑，基因仗处，DNA眯勾，染色體 核酸：一種通常位于細(xì)胞核內(nèi)的大型生物分子，主要負(fù)責(zé)生物體遺傳信息的攜帶和傳遞婆誓。核酸有...
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如何快速將參考基因組拆分為各條染色體序列吃环？
需求 客戶反映，完整的基因組太大打不開(kāi)洋幻，要我將之按各條染色體和scaffold拆分郁轻。如何快速實(shí)現(xiàn)？ 方法一 借助工具： 方法二 自己寫腳本：split.pl 運(yùn)行：perl ...
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Bioconductor分析RNA-seq數(shù)據(jù)參考學(xué)習(xí)《R語(yǔ)言與Bioconductor生物信息學(xué)應(yīng)用》第六章 前言 Y叔的公眾號(hào)biobabble發(fā)過(guò)一篇【聽(tīng)說(shuō)你想學(xué)R文留？】,七月份發(fā)的但昨天推送了一次好唯，所以我看到了，看...
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MADS基因家族序列分類MADS基因家族分類 先查看文獻(xiàn)燥翅，了解大概MADS基因家族分類骑篙，如下圖 參考文獻(xiàn)：王力娜, 范術(shù)麗, 宋美珍, et al. 植物MADS-box基因的研究進(jìn)展[J]. 生物...
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轉(zhuǎn)錄組分析1 各種生信數(shù)據(jù)格式fq、fa森书、sam靶端、bam等sra和fq 1 sra或fq（fastq），都是測(cè)序格式的文件凛膏。通俗理解：sra是把雙端測(cè)序的2個(gè)文件合成了1個(gè)杨名，而fq文件是2個(gè)。因?yàn)楹罄m(xù)很多分析儀fastq格式文件進(jìn)行...
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mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemRNA-seq上中游分析需要用到Linux系統(tǒng)的terminal！ 盡管TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中已經(jīng)提供了大量的處理好的表達(dá)矩陣數(shù)據(jù)鄙麦，但是無(wú)論是自身實(shí)驗(yàn)需要典唇，還是從NCBI的GEO...
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微信公眾號(hào)：生物信息學(xué)習(xí)。<br>微信:tuantuan3634（請(qǐng)備注一下姓名和院校）<br>歡迎交流
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喜歡寫代碼的外科醫(yī)生寒波。
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基因結(jié)構(gòu)圖-分分鐘學(xué)會(huì)小編今天給大家介紹一款在線繪制基因結(jié)構(gòu)的工具Gene Structure Dispaly Server级野，簡(jiǎn)單好用功能還挺強(qiáng)大页屠。運(yùn)用它能夠繪制清晰的基因結(jié)構(gòu)，清晰明了地展示外顯...
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RNA_seq:將修剪后的序列比對(duì)到參考基因組比對(duì)參考基因組的2種軟件：hisat2、subjunc hisat2軟件 1辰企、構(gòu)建索引： 官網(wǎng)下載：https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/m...
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蛋白組學(xué)生物信息資源列表前言 在工業(yè)界风纠，天天做著重復(fù)的簡(jiǎn)單工作，已失去了對(duì)領(lǐng)域新技術(shù)發(fā)展的敏感性和好奇心牢贸，對(duì)技術(shù)人員來(lái)說(shuō)這是件可怕的事情竹观。因?yàn)闆](méi)時(shí)間，也沒(méi)興趣看文獻(xiàn)潜索，不能掌握第一手資料臭增，只能在網(wǎng)上找...
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基因組注釋文件格式 --（一）BED文件格式
轉(zhuǎn)載：https://biozx.top/bed.html[https://biozx.top/bed.html] 參考 UCSC數(shù)據(jù)文件格式[http://genome.u...
