當(dāng)一個(gè) NGS 項(xiàng)目中對(duì)同一個(gè)樣本進(jìn)行了 WGS 和 RNA-seq 測(cè)序镜悉，或者對(duì)同一個(gè)腫瘤患者的腫瘤組織和癌旁組織同時(shí)進(jìn)行 WGS / WES / RNA-seq / Ch...
iGEMDOCK是一個(gè)臺(tái)灣產(chǎn)的分子對(duì)接軟件怖竭，其優(yōu)勢(shì)是簡(jiǎn)單易用锥债，對(duì)接準(zhǔn)確度較高，可以用于初篩和精度對(duì)接痊臭，也可用于金屬對(duì)接（注：未試）哮肚。最后更新為2008年，但對(duì)接軟件近幾年發(fā)展...
tags： gatk bug 問題發(fā)現(xiàn) 我用 GATK 模塊 CombineVariants 合并了 12 個(gè)樣本的 VCF 文件广匙，之后發(fā)現(xiàn)部分位點(diǎn) FORMAT 字段缺少了...
tags： linux centos latex texlive 下載安裝鏡像 - Texlive2017 Texlive 是 Tex 的一種比較流行的發(fā)行版允趟，windows...
為了解決自動(dòng)化報(bào)告之類的問題，測(cè)試了幾種不同的方案之后鸦致，我選了 LaTex潮剪。利用 LaTex 生成 PDF 文檔可定制性強(qiáng)，排版精美分唾，雖然不像 HTML 可以互動(dòng)抗碰，但是 La...
tags： NGS duplication 不管從哪個(gè)角度看我們都希望測(cè)序儀產(chǎn)出的數(shù)據(jù)中 duplicate 率盡量低。怎樣降低 duplicate 率绽乔？ 構(gòu)建文庫時(shí)改含，核酸提...
整理/Mr楠先生 導(dǎo)讀: 美國姑娘 BELLE BETH COOPER 她簡(jiǎn)直就是活在你新學(xué)期計(jì)劃里的人物 一位典型的“晨型人” 從不拖延自控力強(qiáng) 最近她寫了一篇很火的文章 ...
文/北府涵 1. 我經(jīng)常認(rèn)識(shí)到生命有限捍壤，我想做的事情還有很多骤视，我應(yīng)該珍惜時(shí)光，在我腦力最好的狀態(tài)下做最多的事情鹃觉。 同時(shí)我也經(jīng)常有一種想法专酗，就是趁年輕多玩會(huì)。這兩種想法一直和平...
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過濾對(duì)后續(xù)分析至關(guān)重要仅仆，去除一些無用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效率器赞。Trimmomatic 是...
tags： fastq clumpify linux pigz axel Ctrl+R 子曰：“工欲善其事，必先利其器墓拜∪” 多線程超快速壓縮工具 pigz pigz 是 li...
