240 發(fā)簡(jiǎn)信
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    Python安裝pyradiomics報(bào)錯(cuò)

    報(bào)錯(cuò)無(wú)法構(gòu)建SimpleITK包 處理辦法比較簡(jiǎn)單勾哩,安裝一個(gè)較低版本的SimpleITK即可蓖扑,實(shí)測(cè)1.2.4可用戒祠。 該報(bào)錯(cuò)處理過(guò)程來(lái)自CSDN博...

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    【影像組學(xué)從0單排】如何處理shape長(zhǎng)度大于3的圖像

    處理大量醫(yī)學(xué)影像的時(shí)候朝蜘,可能會(huì)夾雜一些非CT或者M(jìn)RI的影像,從而導(dǎo)致批量的循環(huán)報(bào)錯(cuò)铅搓,比如在一堆CT中摻雜了一個(gè)重建圖像: 通過(guò)讀取文件的hea...

  • Python中merge函數(shù)的用法

    示例代碼如下: 輸出的結(jié)果如下: 總結(jié)一下拗慨,內(nèi)連接就是取交集,外連接取并集京景,左連接和右連接是按其中某個(gè)的行去merge窿冯。

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    python安裝導(dǎo)入openslide報(bào)錯(cuò)

    做病理組學(xué)研究,需要安裝和導(dǎo)入openslide包确徙,但是這個(gè)包比較特殊醒串,安裝起來(lái)比較麻煩。記錄如下鄙皇。 安裝 最開(kāi)始通過(guò)conda安裝芜赌,換了幾個(gè)c...

  • 掃描服務(wù)器上未占用的端口并用于python

    掃描端口 下載好Xshell后,再下載安裝一個(gè)nmap插件伴逸。下載地址: 安裝完成后缠沈,打開(kāi)shell,不用登錄服務(wù)器错蝴,直接在本地運(yùn)行命令 -p 參...

  • 在服務(wù)器上新建python環(huán)境并使用jupyterlab

    連接服務(wù)器 通過(guò)xshell連接到服務(wù)器洲愤。 配置環(huán)境并安裝依賴 在xshell中新建一個(gè)環(huán)境 創(chuàng)建完環(huán)境后,需要執(zhí)行conda init命令來(lái)初...

  • R語(yǔ)言biomart包獲取小鼠的基因長(zhǎng)度

    接上回的故事顷锰,公司給了新一批的數(shù)據(jù)柬赐,但是批次效應(yīng)比較重,需要去批次官紫。去批次之后肛宋,fpkm出現(xiàn)了負(fù)值,但是counts在很多分析里不能直接用束世,所以...

  • R語(yǔ)言讀入表格報(bào)錯(cuò)

    師姐發(fā)我新的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)讓我處理酝陈,是一個(gè)103M的txt文件,我的小電腦跑得慢毁涉,就嘗試直接用R讀進(jìn)來(lái)試一下沉帮。 但是出現(xiàn)了如下的報(bào)錯(cuò): 我一開(kāi)始沒(méi)注...

  • pyradiomics報(bào)錯(cuò)“Inputs do not occupy the same physical space”

    今天遇到pyradiomics的一個(gè)新報(bào)錯(cuò),記錄一下還是在提取特征的時(shí)候薪丁,彈出了報(bào)錯(cuò): 關(guān)鍵的字段是“Inputs do not occupy ...

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