這篇文章針對同一個任務(wù)進(jìn)行了單線程声畏，多線程和CUDA程序的比較。以顯示GPU在并行計算上的時間節(jié)省能力。對GPU編程不了解的同學(xué)插龄，這篇文章可能不會有特別大的幫助愿棋，因為我不打算...
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CUDA，多線程蒋畜，單線程比較（密集恐懼癥慎入） -
科研文章發(fā)表的成功要素
由于臨近博士畢業(yè)，沒有再進(jìn)行更多的生信技能的學(xué)習(xí)均牢，主要精力都是放在文章發(fā)表糠雨，畢業(yè)論文寫作方面。今天的推文繼續(xù)和大家分享一篇非常好的文章“What makes a plant ...
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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡信不回答問題，有問題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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轉(zhuǎn)座子（TE,散在重復(fù)）特征及其對基因組影響基因組中重復(fù)序列大體分為兩類：串聯(lián)重復(fù)（Tandem repeats垮庐，Tandem Duplication） （TRF可預(yù)測）散在重復(fù)（Dispersed repeats）松邪，...
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生信課程筆記4-序列算法補(bǔ)充
早期動態(tài)規(guī)劃算法 比較兩個序列的相似性（similarities）寒亥。 編輯距離（edit distance） 加權(quán)編輯距離（weighted edit distance）和相...
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「一文搞定序列比對算法」Global以及Local Alignment序列比對算法的實現(xiàn)序列比對是什么以及序列比對主要的作用是什么邮府，本篇博客就一筆帶過，因為不是主要分享內(nèi)容护盈。 序列比對挟纱，此處引申為pairwise alignment會更加恰當(dāng)一些，用于比較2條序...
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數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)——最大堆一腐宋、堆 堆（英語：heap)是計算機(jī)科學(xué)中一類特殊的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的統(tǒng)稱紊服。堆通常是一個可以被看做一棵樹的數(shù)組對象。堆總是滿足下列性質(zhì)： 堆中某個節(jié)點的值總是不大于或不小于其父節(jié)點的...
