寫在前面 早前已經推過《新手eggNOG-Mapper詳細教程》据悔，但仍然有很多人遇到使用問題。換句話命黔，可能那個教程不能徹底解決大伙遇到的問題苦丁。于是我決定寫一個完美的教程西傀，徹底...
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零基礎快速完成基因功能注釋 / GO / KEGG / PFAM... -
2023-12-23GO&KEGG富集分析eggNOG-mapper功能注釋eggNOG-mapper功能注釋 http://eggnog-mapper.embl.de/[http://eggnog-mapper.embl.de/] eggNOG (...
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E. coli ST1193比較基因組文章 標題：Phylogenetic Analysis Reveals Distinct Evolutionary Trajectories of the Fluoroqui...
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R數據可視化: PCA和PCoA圖, 2D和3D前言 主成分分析(Principal Components Analysis，PCA)，也稱主分量分析或主成分回歸分析法跃巡，是一種無監(jiān)督的數據降維方法汤善。PCA通過線性變換將原始...
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[R語言可視化-精美圖形繪制系列]--主成分分析（PCA）本期內容為[R語言可視化-精美圖形繪制系列]--主成分分析（PCA） 主成分分析：PCA（Principal Component Analysis）是一種常用的數據分析方法什猖。...
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R語言計算β多樣性指數及分析計算β多樣性指數需要用到phyloseq包。它的安裝方式不同于簡單的install.packages（“phyloseq”） 有兩種方法可以安裝 1.先安裝BiocManag...
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R語言：unifrac的計算
Unifrac是一個十分常用的衡量不同群落之間譜系結構差異的指標红淡。在R語言中不狮，計算unifrac的函數不只一種，不同函數之間有什么差別呢在旱？本文目的就是對幾個常用的計算unif...
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R：Bray-Curtis PCoA導讀 Bary-Curtis PCoA降維分析菌群結構摇零。 一、輸入數據 1.1 菌屬豐度矩陣 1.2 樣品分組 二桶蝎、BC PCoA函數 三驻仅、分析及結果 3.1 結果文件 3....
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7. vegan包進行PCoA分析和可視化簡介 PCoA分析谅畅，即主坐標分析（principal co-ordinates analysis），是一種非約束性的數據降維分析方法噪服，可用來研究樣本的相似性或差異性铃彰，與PCA...
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當物種組成柱狀圖配上聚類數前兩天在公眾號植物與根際微生物生態(tài)看到一篇轉載的文章，關于聚類與物種組成柱狀圖的： 翻看了作者的代碼芯咧，基本是用R base寫的牙捉，我想著能不能用Y數的ggtree?結合ggpl...
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ggplot2繪制Alpha多樣性指數圖經過前面幾節(jié)的原始數據處理過程，得到了可以用于分析的數據敬飒，現在讓我們開始微生物組數據分析可視化的第一步邪铲，繪制Alpha多樣性指數圖，喜歡的小伙伴歡迎關注個人公眾號R語言數據分...
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16S測序分析（六）用PICRUSt預測菌群KEGG代謝通路
導讀 PICRUSt (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved S...
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16S測序分析（五）用RandomForest尋找關鍵細菌導讀 用隨機森林“分類”的方法尋找16S測序數據中與分組有關的細菌无拗。 一带到、數據準備 標準化細菌豐度表格式要求：不用放樣本ID；最后一列放分組變量 二英染、R分析準備 三揽惹、隨機森林...
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SpringBoot+Vue前后端分離（CURD）Demo我發(fā)現我好久沒有更新了，寫一篇證明我還活著四康。既然是前后端分離的話搪搏，肯定是要有前端和后端的。這里前端我使用的Vue+ElementUI,后端采用的是SpringBoot+Myb...
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Vue3寫一個后臺管理系統（4）RBAC權限受控體系的實現一闪金、RBAC 權限控制體系 要實現動態(tài)Menu疯溺，我們需要先來統一一下認知，明確項目中的權限控制系統哎垦。網上找了張圖囱嫩，我們可以大致的看下 從圖中，我們可以簡單的這樣理解RBAC ...
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vue2.0 + element-ui 多級導航菜單自從用餓了么框架重構項目以來漏设，遇到 很多問題墨闲，我都有一一記錄下來，現在特喜歡這個框架郑口，說實話鸳碧，如果你是用了vue這個技術棧的話，一定要用餓了么的pc端框架哦潘酗，遇到問題的時候在...