寫在前面 早前已經(jīng)推過《新手eggNOG-Mapper詳細(xì)教程》，但仍然有很多人遇到使用問題尔许。換句話终娃，可能那個(gè)教程不能徹底解決大伙遇到的問題味廊。于是我決定寫一個(gè)完美的教程，徹底...
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零基礎(chǔ)快速完成基因功能注釋 / GO / KEGG / PFAM... -
2023-12-23GO&KEGG富集分析eggNOG-mapper功能注釋eggNOG-mapper功能注釋 http://eggnog-mapper.embl.de/[http://eggnog-mapper.embl.de/] eggNOG (...
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E. coli ST1193比較基因組文章 標(biāo)題：Phylogenetic Analysis Reveals Distinct Evolutionary Trajectories of the Fluoroqui...
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R packages：phyloseq（三） 16s 擴(kuò)增子β多樣性分析導(dǎo)入數(shù)據(jù) PCoA 生成排序矩陣 碎石圖來查看排名前幾的軸的貢獻(xiàn)率 NMDS 非度量多維尺度分析
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R數(shù)據(jù)可視化: PCA和PCoA圖, 2D和3D前言 主成分分析(Principal Components Analysis窍荧，PCA)辉巡，也稱主分量分析或主成分回歸分析法，是一種無監(jiān)督的數(shù)據(jù)降維方法蕊退。PCA通過線性變換將原始...
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[R語言可視化-精美圖形繪制系列]--主成分分析（PCA）本期內(nèi)容為[R語言可視化-精美圖形繪制系列]--主成分分析（PCA） 主成分分析：PCA（Principal Component Analysis）是一種常用的數(shù)據(jù)分析方法。...
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R語言計(jì)算β多樣性指數(shù)及分析計(jì)算β多樣性指數(shù)需要用到phyloseq包咕痛。它的安裝方式不同于簡單的install.packages（“phyloseq”） 有兩種方法可以安裝 1.先安裝BiocManag...
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R語言：unifrac的計(jì)算
Unifrac是一個(gè)十分常用的衡量不同群落之間譜系結(jié)構(gòu)差異的指標(biāo)。在R語言中茉贡，計(jì)算unifrac的函數(shù)不只一種，不同函數(shù)之間有什么差別呢？本文目的就是對幾個(gè)常用的計(jì)算unif...
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R：Bray-Curtis PCoA導(dǎo)讀 Bary-Curtis PCoA降維分析菌群結(jié)構(gòu)放椰。 一作烟、輸入數(shù)據(jù) 1.1 菌屬豐度矩陣 1.2 樣品分組 二砾医、BC PCoA函數(shù) 三拿撩、分析及結(jié)果 3.1 結(jié)果文件 3....
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7. vegan包進(jìn)行PCoA分析和可視化簡介 PCoA分析如蚜，即主坐標(biāo)分析（principal co-ordinates analysis）压恒，是一種非約束性的數(shù)據(jù)降維分析方法，可用來研究樣本的相似性或差異性错邦，與PCA...
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當(dāng)物種組成柱狀圖配上聚類數(shù)前兩天在公眾號植物與根際微生物生態(tài)看到一篇轉(zhuǎn)載的文章，關(guān)于聚類與物種組成柱狀圖的： 翻看了作者的代碼撬呢，基本是用R base寫的伦吠，我想著能不能用Y數(shù)的ggtree?結(jié)合ggpl...
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ggplot2繪制Alpha多樣性指數(shù)圖經(jīng)過前面幾節(jié)的原始數(shù)據(jù)處理過程魂拦，得到了可以用于分析的數(shù)據(jù)毛仪，現(xiàn)在讓我們開始微生物組數(shù)據(jù)分析可視化的第一步，繪制Alpha多樣性指數(shù)圖芯勘，喜歡的小伙伴歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號R語言數(shù)據(jù)分...
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16S測序分析（六）用PICRUSt預(yù)測菌群KEGG代謝通路
導(dǎo)讀 PICRUSt (Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved S...
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16S測序分析（五）用RandomForest尋找關(guān)鍵細(xì)菌導(dǎo)讀 用隨機(jī)森林“分類”的方法尋找16S測序數(shù)據(jù)中與分組有關(guān)的細(xì)菌。 一借尿、數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 標(biāo)準(zhǔn)化細(xì)菌豐度表格式要求：不用放樣本ID；最后一列放分組變量 二路翻、R分析準(zhǔn)備 三、隨機(jī)森林...
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SpringBoot+Vue前后端分離（CURD）Demo我發(fā)現(xiàn)我好久沒有更新了茄靠，寫一篇證明我還活著茂契。既然是前后端分離的話，肯定是要有前端和后端的掉冶。這里前端我使用的Vue+ElementUI,后端采用的是SpringBoot+Myb...
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Vue3寫一個(gè)后臺管理系統(tǒng)（4）RBAC權(quán)限受控體系的實(shí)現(xiàn)一、RBAC 權(quán)限控制體系 要實(shí)現(xiàn)動(dòng)態(tài)Menu脐雪，我們需要先來統(tǒng)一一下認(rèn)知厌小，明確項(xiàng)目中的權(quán)限控制系統(tǒng)。網(wǎng)上找了張圖战秋，我們可以大致的看下 從圖中璧亚，我們可以簡單的這樣理解RBAC ...
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vue2.0 + element-ui 多級導(dǎo)航菜單自從用餓了么框架重構(gòu)項(xiàng)目以來脂信，遇到 很多問題癣蟋，我都有一一記錄下來透硝，現(xiàn)在特喜歡這個(gè)框架，說實(shí)話疯搅，如果你是用了vue這個(gè)技術(shù)棧的話濒生，一定要用餓了么的pc端框架哦，遇到問題的時(shí)候在...