TEtranscripts對(duì)轉(zhuǎn)座子定量分析贵扰,可以使用mRNA轉(zhuǎn)錄測(cè)序數(shù)據(jù)嗎[抱拳]
TEtranscripts--計(jì)算轉(zhuǎn)座子(TEs)在RNA-seq中的定量和差異表達(dá)寫在前面仇穗,最近為了解決這個(gè)問(wèn)題,看了很多軟件戚绕,要么是單細(xì)胞技術(shù)纹坐,要么是物種限制,總之花了挺多時(shí)間舞丛。本來(lái)打算使用SQuIRE恰画,但是卡在了BUILD_refGene.txt(基因...
請(qǐng)問(wèn)TEtranscripts對(duì)轉(zhuǎn)座子定量分析,可以使用mRNA轉(zhuǎn)錄測(cè)序數(shù)據(jù)嗎[抱拳]
TEtranscripts:包含轉(zhuǎn)座原件的的RNA-seq差異表達(dá)分析導(dǎo)讀 主頁(yè):http://hammelllab.labsites.cshl.edu/software/Github:https://github.com/mhammell-l...