1.什么是k-mer? k-mer:在生物信息學(xué)中泛鸟,k-mers是包含在生物序列中的長(zhǎng)度為k的子序列蝠咆。 比如序列:GTAGAGCTGT,根據(jù)k值不同,可得到以下k-mer北滥。 ...
群體進(jìn)化與選擇信號(hào):●生活在世界不同區(qū)域的生物群體在歷史長(zhǎng)河中經(jīng)歷千萬(wàn)年的自然選擇刚操、人工馴化、遷徙再芋、遺傳漂變等事件的洗禮菊霜,有的物種滅絕,有的物種分化出不同的亞種或亞群,甚至逐...
作者:biofan審稿:童蒙編輯:amethyst 繼一文看懂病原微生物檢測(cè)(上篇)[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA3MjM5NTE4...
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RSEM RSEM是對(duì)基因進(jìn)行表達(dá)定量的一個(gè)軟件,是基于STAR序列對(duì)比的基礎(chǔ)之上進(jìn)行的资柔。而kallisto不需要進(jìn)行比對(duì)可以直接定量焙贷。 安裝 conda install r...
前幾天分享的都是期刊、科研生活上的推文贿堰,現(xiàn)在分享一下生信數(shù)據(jù)挖掘+實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證(4分SCI思路)的文章辙芍。本次分享的參考范文發(fā)表Molecular Medicine上,該期刊的影響...
--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件的工具合集徘层。能夠?qū)崿F(xiàn)二進(jìn)...
一猪贪、簡(jiǎn)介 Samtools是一個(gè)用于操作sam和bam格式文件的應(yīng)用程序集合跷敬,具有眾多的功能。 它從SAM(序列比對(duì)/映射)格式導(dǎo)入和導(dǎo)出哮伟,進(jìn)行排序干花,合并和索引妄帘,并允許快速檢...