本科畢業(yè)于浙江大學(xué)浸踩，碩士畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)，浙大讀博ing傻挂。<br>如果沒有及時(shí)回復(fù)可以發(fā)送郵件：jlyq617@gmail.com
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這幾種標(biāo)準(zhǔn)化方式哪一種最好呢
使用deeptools將bam文件轉(zhuǎn)換為bw文件
整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析時(shí)用到的工具乘碑。本文只對使用的工具用法進(jìn)行簡單介紹。 deeptools 提供兩個(gè)bam轉(zhuǎn)換為bw的命令金拒，分別是bamCove...
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得到差異peak后怎么知道與相關(guān)基因聯(lián)系起來呢兽肤，是將這些差異peak進(jìn)行注釋嗎
第9篇：差異peaks分析——DiffBind
學(xué)習(xí)目標(biāo) 學(xué)習(xí)用DiffBind流程評估兩個(gè)樣本間的差異結(jié)合區(qū)域 用PCA評估樣本間的關(guān)系 評估不同工具得到的差異peaks的一致性 評估差異peaks富集的工具 ATAC-...
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@geneonto 那如果是雙端測序，是不是一個(gè)樣本要寫兩行
原始數(shù)據(jù)上傳NCBI-轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
經(jīng)常碰到老師在文章接收過程中绪抛，編輯要求將原始數(shù)據(jù)上傳NCBI资铡，要是沒有數(shù)據(jù)上傳經(jīng)驗(yàn)的不要慌，小編手把手教你如何快速上傳數(shù)據(jù)至NCBI （一）NCBI賬號：上傳數(shù)據(jù)必須有自己的...
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題主你好幢码，我在填寫樣本信息表的時(shí)候一直出現(xiàn)error,我填寫的如下
GV_WT1
GV_WT2
GV_WT3
GV_WT4
MII_WT1
MII_WT2
MII_WT3
MII_WT4
GV_CKO1
GV_CKO2
GV_CKO3
GV_CKO4
MII_CKO1
MII_CKO2
MII_CKO3
MII_CKO4
請問是哪里有問題笤休，我應(yīng)該如何修改呢原始數(shù)據(jù)上傳NCBI-轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
經(jīng)常碰到老師在文章接收過程中，編輯要求將原始數(shù)據(jù)上傳NCBI症副，要是沒有數(shù)據(jù)上傳經(jīng)驗(yàn)的不要慌店雅，小編手把手教你如何快速上傳數(shù)據(jù)至NCBI （一）NCBI賬號：上傳數(shù)據(jù)必須有自己的...
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原始數(shù)據(jù)上傳NCBI-轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)經(jīng)常碰到老師在文章接收過程中政基，編輯要求將原始數(shù)據(jù)上傳NCBI，要是沒有數(shù)據(jù)上傳經(jīng)驗(yàn)的不要慌闹啦，小編手把手教你如何快速上傳數(shù)據(jù)至NCBI （一）NCBI賬號：上傳數(shù)據(jù)必須有自己的...
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生信阿拉丁窍奋，為實(shí)用而生
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題主你好荐健，我看文獻(xiàn)中mouse fibroblasts做了GelCut和沒有GelCut的smart-seq3，為什么這兩種情況下barcode不同费变，只是為了區(qū)分這兩種情況嗎
你要的單細(xì)胞全長轉(zhuǎn)錄本建庫方案：smart-seq3來了
作者：堯小飛審稿：童蒙編輯：amethyst 01 背景介紹 目前在NGS的科技服務(wù)市場上單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和三代是最火的兩個(gè)方向摧扇，也是由于工業(yè)技術(shù)升級帶來的研究的新方向和新視野（...
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老師您好，如果有生物學(xué)重復(fù)挚歧，代碼應(yīng)該怎么寫呢
使用Trinity進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組組裝
Trinity是Broad Institute和Hebrew University of Jerusalem開發(fā)的RNA-Seq數(shù)據(jù) 轉(zhuǎn)錄組組裝工具扛稽，包括三個(gè)模塊， Inch...
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@鹿無為 我也沒有找到滑负，可以分享一下鏈接嗎
從spike-in矯正到DESeq2的原理
寫在前面的廢話 最近在處理一批RNA-seq的數(shù)據(jù)在张，里面混入了spike-in。利用spike-in矯正之后矮慕，樣本A的基因表達(dá)量普遍比樣本B的基因表達(dá)量高3-5倍帮匾，這和我所熟...
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作者可以發(fā)一下這篇文章的鏈接嗎
RNA-seq的十年（下）
前言 這一部分的內(nèi)容主要涉及單細(xì)胞測序，空間轉(zhuǎn)錄組痴鳄，新生RNA測序瘟斜，翻譯組，RNA-RNA之間相互作用痪寻，RNA-蛋白質(zhì)相互作用以及未來展望螺句。 常規(guī)RNA-seq進(jìn)階 源于整塊...
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<br>請關(guān)注“生信天地”獲取更多生信優(yōu)質(zhì)資源蛇尚！
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RNA-seq的十年（下）
前言 這一部分的內(nèi)容主要涉及單細(xì)胞測序，空間轉(zhuǎn)錄組顾画，新生RNA測序取劫，翻譯組，RNA-RNA之間相互作用研侣，RNA-蛋白質(zhì)相互作用以及未來展望谱邪。 常規(guī)RNA-seq進(jìn)階 源于整塊...
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請問用的R是哪個(gè)版本，我安裝xtail一直顯示installation of package ‘/home/data/vip55/software/xtail_1.1.5-source.tar.gz’ had non-zero exit status
安裝R包DESeq2和xtail
安裝R包DESeq2和xtail 安裝網(wǎng)址：https://github.com/xryanglab/xtail/blob/master/INSTALL 安裝DESeq2 尋...
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@鹿無為 @鹿無為 我在想非鏈特異性建庫應(yīng)該無法區(qū)分正負(fù)鏈吧璧函，只能是鏈特異性建庫才行
鏈特異性建庫如何區(qū)分正負(fù)鏈？
寫在前面的廢話 經(jīng)過這兩周意外的斷更基显，我明白了一個(gè)道理蘸吓，人都是具有慣性的…… 兩周沒寫公眾號，我似乎都習(xí)慣了懶惰撩幽，文章不想更了库继，筆記也懶得記了。 但是我沒忍住雙十一的誘惑窜醉，一...
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生信坑底躺著不動(dòng)的男人<br>簡書不常在榨惰，有問題可私信
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@鹿無為 為什么我找不到score列
鏈特異性建庫如何區(qū)分正負(fù)鏈拜英？
寫在前面的廢話 經(jīng)過這兩周意外的斷更，我明白了一個(gè)道理琅催，人都是具有慣性的…… 兩周沒寫公眾號居凶，我似乎都習(xí)慣了懶惰，文章不想更了藤抡，筆記也懶得記了侠碧。 但是我沒忍住雙十一的誘惑，一...
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如果不是鏈特異性測序也是這樣來提取嗎
鏈特異性建庫如何區(qū)分正負(fù)鏈缠黍？
寫在前面的廢話 經(jīng)過這兩周意外的斷更弄兜，我明白了一個(gè)道理，人都是具有慣性的…… 兩周沒寫公眾號瓷式，我似乎都習(xí)慣了懶惰替饿，文章不想更了，筆記也懶得記了蒿往。 但是我沒忍住雙十一的誘惑盛垦，一...
