發(fā)簡信
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多變量孟德爾隨機化MVMR孟德爾隨機化推斷暴露因素與健康結(jié)局的因果關(guān)系[http://www.reibang.com/p/8ac31267d3d8] TwoSampleMR：兩樣本孟德爾隨機化[ht...
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TwoSampleMR 遇到的坑
第一次嘗試醫(yī)學(xué)統(tǒng)計常用的MR噪矛，我選擇了比較多用的R包，TwoSampleMR, 這個包還有一個webApp -- MRbase.所有流程基本和網(wǎng)上可以搜到的一樣铺罢，這里推薦這個...
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醫(yī)學(xué)生，公眾號“生信與臨床”泉瞻，歡迎大家關(guān)注脉漏。<br><br>
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數(shù)據(jù)分析鸠删、BI 路上的行者！Ｔ籼铡刃泡！
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cox臨床預(yù)測模型構(gòu)建
#單因素cox回歸用于篩選與預(yù)后相關(guān)的免疫基因 #文件要求墓怀，帶有臨床生存與基因表達值的文件clinical+exp.txt #生信課視頻上的代碼：不知道為什么就是運行不出來汽纠，...
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Wilcoxon檢驗方法差異分析
文件要求：正常與腫瘤組的mRNA表達量 本次前50列是正常組，后374是腫瘤樣本 setwd("C:/Users/仙女/Documents/liver cancer") li...
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為什么說FPKM和RPKM都錯了碴犬？
這本是三年多之前我發(fā)在公眾號上的一篇舊文絮宁，一些偶然的機會，發(fā)現(xiàn)不少朋友也在討論這個問題服协，因此我重新做了梳理并發(fā)出來绍昂。這樣的討論是有益的，放在今天也不過時偿荷，我也愿意和更多的朋友...
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RNA-seq中的那些統(tǒng)計學(xué)問題（二）FPKM/RPKM之外的那些標準化方法目錄 1. 標準化1.1. House-keeping gene(s)1.2. spike-in1.3. CPM1.4. TCS1.5. Quantile1.6. Media...
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不常上線遭顶，有事可以找@547的小書童呀
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從TCGA數(shù)據(jù)中提取lncRNA(這是一個找bug教程)從果子老師的從TCGA數(shù)據(jù)中提取lncRNA并進行下游分析一文中张峰，我學(xué)到了如何從TCGA表達譜數(shù)據(jù)中提取RNA。老師的教程已經(jīng)寫的很詳細了棒旗，我再補充一點：如何下載GTF注視文...
