ytbao

轉座子鑒定方法 轉座子的鑒定方法基本歸于兩大類：從頭預測蝠嘉、基于同源比對。 從頭預測算法 de novo 包括：基于基因組序列比對的方法骇扇、K-mer 方法映砖、基于結構特征的方法基...

生信石頭

寫在前面 早前我在 TBtools 中基于NG86邏輯實現(xiàn) Ka/Ks 計算時走了不少彎路，其中種種，或許只有 Coding 的人才知道竹宋。當然劳澄，其中還另外牽扯到如何快速進行序...

我與生信

在這篇文章中，作者提到候選基因受到正選擇蜈七∶氚危看附表19給的數(shù)據(jù)，該說法的依據(jù)是作者對普通蕎麥和苦蕎的直系同源基因對做了Ka/Ks分析飒硅，其值大于1砂缩。 今天的推送，將介紹如何對兩個...

程涼皮兒

參考學習資料：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GeneOverlap/inst/do...

箋牒九州的怪咖

最近在學習ATAC-seq三娩，整理了筆記分享一下庵芭，歡迎批評指正 a、為啥要ATAC-seq? ATAC-seq全稱Assay for Transposase Accessibl...

Bio_Infor

不積跬步無以至千里 deeptools作為分析深度測序數(shù)據(jù)的一大利器雀监，受到了廣泛的歡迎和關注双吆，這一點從Github的星標數(shù)以及conda的安裝次數(shù)就可以知道，很多人都對它非常...

TOP生物信息

適用范圍不同 bar圖x一般為離散變量滔悉，直方圖x一般為連續(xù)變量 默認的統(tǒng)計變換不同 前者是stat = "count"伊诵，統(tǒng)計一個數(shù)量就完事了单绑，即生成新變量..count..d...

我與生信

本次推送是文獻分享16的對應內(nèi)容回官。 Fig 1 有效群體大小的估計或者種群歷史動態(tài)的估計經(jīng)常出現(xiàn)在基因組/重測序相關文章中，可視化形式一般是Fig 1搂橙。 Fig 1的解讀：由...