sam轉(zhuǎn)bam運(yùn)行samtools view -@ 16 -b XXX.sam >xxx.bam后報(bào)錯(cuò)[W::sam_read1] parse error at line 1...
發(fā)簡信
IP屬地：山西
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避坑 sam轉(zhuǎn)bam
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heatmap由于有太多NA無法聚類原因和解決方法有的時(shí)候數(shù)據(jù)中有NA寄月，可以聚類出來刽辙，但是有的時(shí)候就會報(bào)一個(gè)這樣的錯(cuò)誤：“Error in hclustfun(distfun(x)) : NA/NaN/Inf in fore...
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菜??日記-轉(zhuǎn)錄組edgeR分析差異基因及案例演示菜??的第一次正式上手R，相當(dāng)于翻譯了 edgeR 這個(gè)包的 UserGuide荠割，跑了第一個(gè) case眼看寫了這么多字吟宦，還是發(fā)一下比較好疫衩，萬一有人看呢 edgeR簡介 edge...
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找 illumina 接頭序列1.https://support.illumina.com.cn/downloads/illumina-adapter-sequences-document-1000000...
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高通量測序中的接頭（adapter）到底是什么主要參考 祝讓飛 的文章及 Tufts 網(wǎng)站中的信息钮呀，特此致謝。 首先放一張測序示意圖怜浅，在DNA片段兩端所加的序列即接頭序列铐然，也就是我們今天要講述的主角。 1 基本概念 1....
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HISAT2 Bowtie2 提取唯一比對 unique mapping reads
把read比對到基因組之后，需要提取唯一比對來進(jìn)行下一步分析锦爵。 bowtie2和HISAT2 都沒有只輸出唯一比對的命令舱殿，所以需要對比對結(jié)果sam文件進(jìn)行提取，可以通過sam...
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R可視化：使用R的circlize包繪制樣本-物種豐度關(guān)聯(lián)弦狀圖R作圖-使用circlize繪制樣本物種豐度關(guān)聯(lián)弦狀圖 circlize圖也即是弦圖能較好展示樣本物種豐度關(guān)聯(lián)關(guān)系险掀，先前從lyao222lll博客下載過該教程沪袭，但是最近劉老師...
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R語言circlize包畫一幅好看的弦圖~完整示例數(shù)據(jù)和代碼前些天在網(wǎng)上看到的代碼，他最終的出圖如下 這份教程的鏈接地址是 https://www.royfrancis.com/beautiful-circos-plots-in-r/...
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文獻(xiàn)精讀-24nt-siRNA介導(dǎo)的DNA甲基化（RdDM）不定期更新Author: Marijori A. Matzke and Rebecca A. MosherJournal: Nature Review Geneticsdoi: 10....
