比如酌伊,我最近在讀取一個(gè)excel表格青自,里面的數(shù)據(jù)是這樣的,是代謝物的名稱: 如果我直接讀取的話 那么在R里就會(huì)出現(xiàn)這樣的情況圖二 上述情況很麻煩...
編寫:王采荷 感覺已經(jīng)很久沒有在簡書上分享自己的東西了蛹锰,今天在集合其他大佬的力量終于把“如何用R語言做差異代謝物的kegg富集分析”這個(gè)問題給解...
經(jīng)歷過OrthoMCL軟件包安裝的艱辛(然而泥兰,終究也沒安裝成功),就知道轉(zhuǎn)而用BPGA包是有多么香了。話不多說胜臊,來看看BPGA是如何安裝且使用的...
整理:王采荷 一、下載同一種屬不同species下的微生物16S rDNA 使用NCBI網(wǎng)站:https://www.ncbi.nlm.nih....
整理:dayueban 主要目的是方便日常對(duì)測序數(shù)據(jù)伙判,如編碼某個(gè)蛋白的基因在物種間序列上的相似性比較象对。 一、軟件下載和安裝 blast軟件網(wǎng)址:...
編譯:王采荷 關(guān)于進(jìn)化樹(系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹宴抚,Phylogenetic tree)勒魔,一般也叫作系統(tǒng)進(jìn)化樹它的用途我這里就不在贅述了。因?yàn)檫h(yuǎn)的不說菇曲,就...
導(dǎo)讀 菌群分類數(shù)據(jù)的可視化沥邻,包括豐度在個(gè)體之間以以及組間的一個(gè)比較怎么生動(dòng)形象,一直是我想解決的問題羊娃,今天看到一篇文章上面用的是ggplot2包...
由于沒有服務(wù)器唐全,只能自己搗鼓著用windows的cmd命令行來批量下載一些數(shù)據(jù),但是windows下高通量測序數(shù)據(jù)(如sra)下載體驗(yàn)真的很差蕊玷,...
編譯:大月半 責(zé)編:王采荷 2020年初邮利,新型冠狀病毒逐漸開始肆虐全球,其傳染性和致病力和SARS病毒及MERS病毒相比是有過之而無不及垃帅。即便如...