近期，國內(nèi)植物單細(xì)胞RNA測(cè)序相關(guān)研究再發(fā)力。2020年6月24日，河南大學(xué)孫旭武教授課題組在Molecular Plant在線發(fā)表了題為Global Dynamic Mol...
IP屬地：湖北
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國內(nèi)植物單細(xì)胞RNA測(cè)序相關(guān)研究再發(fā)力
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CellRanger走起(四) Cell Ranger流程概覽劉小澤寫于19.5.7主要看流程，這一篇不涉及真實(shí)數(shù)據(jù)展示 總的來說匪蟀，Cell Ranger主要的流程有：拆分?jǐn)?shù)據(jù) mkfastq、細(xì)胞定量 count、定量組合 aggr波岛、...
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學(xué)習(xí)單細(xì)胞測(cè)序
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課程會(huì)在2019年9月底之前錄制完畢并上線： 課程說明在：https://mp.weixin.qq.com/s/AV2uTbsvJGBRq_zv7yDmNg 所有代碼在：https://github.com/jmzeng1314/scRNA_smart_seq2 觀看鏈接 手機(jī)微信觀看（推薦）：http://jm.grazy.cn/wechat/course/detail?cid=53 電腦瀏覽器的鏈接 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53
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解析單細(xì)胞RNA-Seq Nature文章這是我聽孟浩巍知乎Live：生信進(jìn)階第1課-重復(fù)Nature文章和B站視頻：高通量測(cè)序技術(shù)交流錄像里的筆記哦~ 目錄：文章的主要結(jié)論解讀傳統(tǒng)RNA-Seq建庫方法幾種主要的單...
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周運(yùn)來滨砍，男，長大了才會(huì)遇到的帥哥妖异，穩(wěn)健惋戏，瀟灑，大方他膳，靠譜响逢。一段生信緣，一棵技能樹棕孙。生信技能樹核心成員舔亭，單細(xì)胞天地供稿人，簡書創(chuàng)作者蟀俊，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家分歇。
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【r<-基礎(chǔ)|統(tǒng)計(jì)】頻數(shù)檢驗(yàn)
問題 你有分類數(shù)據(jù)然后想要檢驗(yàn)是否這些數(shù)據(jù)值的頻數(shù)分布是否與預(yù)期不符，或者是否組間的頻數(shù)分布有（顯著）差異欧漱。 方案 頻數(shù)檢驗(yàn)通常解決兩類問題： 頻數(shù)分布與預(yù)期或者理論的分布（...
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當(dāng)你用setwd的時(shí)候职抡，能考慮一下Rproject的感受嗎
我在線下課程中講過，R語言文件讀取只有一個(gè)報(bào)錯(cuò)误甚，就是： 傳統(tǒng)的R語言書和課程里會(huì)講缚甩，setwd（）這個(gè)命令是設(shè)置工作目錄用的谱净，所謂工作目錄就是圖片導(dǎo)出、腳本保存擅威、數(shù)據(jù)讀取的默...
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中科院遺傳發(fā)育所博士研究生，科研搬磚工一枚厉熟，專業(yè)植物遺傳學(xué)导盅，生信菜鳥，立志成為一名做得了實(shí)驗(yàn)揍瑟，玩兒得轉(zhuǎn)生信的科研老鳥～
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基因型填充之后如何過濾比如 個(gè)體分型率 < 90% 某一個(gè)樣本測(cè)出來的標(biāo)記小于全部標(biāo)記的90% 標(biāo)記分型率 < 90% 某一個(gè)標(biāo)記只在小于90%的樣本中存在 最小等位基因頻率 < 0.05 這個(gè)一...
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樓主您好白翻，想請(qǐng)教您一下，minQ是如何計(jì)算的绢片，對(duì)應(yīng)vcf文件的哪一個(gè)值滤馍？，我查看了vcf文件的每一項(xiàng)底循，感覺沒有能對(duì)應(yīng)上的巢株，是否經(jīng)過轉(zhuǎn)換
關(guān)于SNP的過濾（1）：如何使用vcftools進(jìn)行SNP過濾
前言 很多關(guān)注我這個(gè)專題的朋友都在后臺(tái)留言，說想了解更多關(guān)于SNP過濾的東西熙涤。是的阁苞，確實(shí)這是一個(gè)比較重要的問題。第一灭袁，過濾到一些低質(zhì)量的SNP可以防止calling一些假陽性...
